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背景：インスリン様成長因子1受容体（IGF1R）は、乳がんの開始と進行における役割により、最近多くの注目を集めています。その遺伝子発現の以前の分析は、新鮮な凍結（FF）サンプルに限定されていましたが、この手法の定期的に処理されたパラフィン包埋（FFPE）サンプルに適用すると、IGF1Rの発現を予後および治療反応と相関させるより大きな遡及的研究が促進される可能性があります。 方法：乳房腫瘍の一連の77のペアのFFPEおよびFF標本を使用して、FFPEサンプルでIGF1R遺伝子発現を定量化する可能性を評価し、FFPEおよびFFサンプルから得られた結果を比較しました。FFPEサンプルを使用したIGF1R遺伝子発現の分析の実現可能性と予後値は、260の原発性乳房腫瘍のコホートで評価されました。 結果：FFPEサンプルの95.4％から総RNAを抽出し、濃度は30 ng/μL以上に抽出しました。TAQMAN方法論に基づくリアルタイムPCRは、FFPEサンプルの90％で成功しました。IGF1R遺伝子発現は、FFPEとFF（スピアマンρ= 0.74）だけでなく、両方のタイプの標本におけるIGF1Rタンパク質発現との強い相関を示しました。Kaplan-Meier分析では、IGF1R mRNAの発現が高いことが、より長い再発のない生存（p = 0.009）および乳がん特異的生存（p = 0.0002）と関連していることが示されました。 結論：FFPE組織におけるIGF1R遺伝子発現の定量分析は、実現可能かつ確実に実施され、浸潤性乳癌の特性と結果に関連する情報を提供します。
背景：インスリン様成長因子1受容体（IGF1R）は、乳がんの開始と進行における役割により、最近多くの注目を集めています。その遺伝子発現の以前の分析は、新鮮な凍結（FF）サンプルに限定されていましたが、この手法の定期的に処理されたパラフィン包埋（FFPE）サンプルに適用すると、IGF1Rの発現を予後および治療反応と相関させるより大きな遡及的研究が促進される可能性があります。 方法：乳房腫瘍の一連の77のペアのFFPEおよびFF標本を使用して、FFPEサンプルでIGF1R遺伝子発現を定量化する可能性を評価し、FFPEおよびFFサンプルから得られた結果を比較しました。FFPEサンプルを使用したIGF1R遺伝子発現の分析の実現可能性と予後値は、260の原発性乳房腫瘍のコホートで評価されました。 結果：FFPEサンプルの95.4％から総RNAを抽出し、濃度は30 ng/μL以上に抽出しました。TAQMAN方法論に基づくリアルタイムPCRは、FFPEサンプルの90％で成功しました。IGF1R遺伝子発現は、FFPEとFF（スピアマンρ= 0.74）だけでなく、両方のタイプの標本におけるIGF1Rタンパク質発現との強い相関を示しました。Kaplan-Meier分析では、IGF1R mRNAの発現が高いことが、より長い再発のない生存（p = 0.009）および乳がん特異的生存（p = 0.0002）と関連していることが示されました。 結論：FFPE組織におけるIGF1R遺伝子発現の定量分析は、実現可能かつ確実に実施され、浸潤性乳癌の特性と結果に関連する情報を提供します。
BACKGROUND: Insulin-like growth factor 1 receptor (IGF1R) has recently received much attention due to its role in initiation and progression of breast cancer. Previously analysis of its gene expression has been restricted to fresh-frozen (FF) samples, but application of this technique to routinely processed formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) samples could facilitate larger retrospective studies correlating IGF1R expression with prognosis and therapeutic response. METHODS: A series of 77 paired FFPE and FF specimens of breast tumors was used to evaluate the possibility of quantifying IGF1R gene expression with FFPE samples and to compare the results obtained from FFPE and FF samples. The feasibility and prognostic value of analyzing IGF1R gene expression using FFPE samples was evaluated in a cohort of 260 primary breast tumors. RESULTS: Total RNA was extracted from 95.4% of the FFPE samples with concentration at least 30 ng/μL. Real-time PCR based on Taqman methodology was successful in 90% of the FFPE samples. IGF1R gene expression showed strong correlation not only between FFPE and FF (Spearman ρ = 0.74), but also with IGF1R protein expression in both types of specimen. Kaplan-Meier analysis showed that higher IGF1R mRNA expression was associated with longer recurrence-free survival (P = 0.009) and breast cancer-specific survival (P = 0.0002). CONCLUSIONS: Quantitative analysis of IGF1R gene expression in FFPE tissues can be feasibly and reliably conducted, and provides information relevant to the characteristics and outcome of invasive breast cancer.
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