UMD-BRCA1/BRCA2データベースに記録されたフランスの遺伝性乳房および卵巣癌家族の遺伝的変異の説明と分析

BRCA1とBRCA2は、タンパク質不活性化モノアレンである変異の結果として、乳がんと卵巣癌の素因の原因となる2つの主要な遺伝子です。これら2つの遺伝子で特定されたバリアントの多く、いわゆる分類/未知のバリアント（UV）が疾患の表現型に寄与するか、単に中性変異体（または多型）であるかどうかはまだ確立されていません。その状況を確立することの臨床的重要性を考えると、これらのUVに注釈を付ける全国的な努力が、フランスのGGCコンソーシアム（GroupeGénétiqueETがん）に属する研究所によって開始され、UMD-BRCA1/BRCA2データベースの作成につながりました（http：///www.umd.be/brca1/およびhttp://www.umd.be/brca2/）。これらのデータベースは、フランス国立がん研究所（INCA）によって承認されており、因果関係、ニュートラル、またはUVなど、フランスで検出されたすべてのバリアントを収集するように設計されています。それらは、すべてのバリアントの共起データを含むという点で、他のBRCAデータベースとは異なります。これらのデータを使用して、GGCフランスのコンソーシアムは、他のデータベースにも含まれる特定のUVSを分類することができました。この記事では、BICデータベースに含まれていないいくつかの新しいUVを報告し、構造的アプローチに基づいて癌の素因への影響を調査します。

BRCA1 and BRCA2 are the two main genes responsible for predisposition to breast and ovarian cancers, as a result of protein-inactivating monoallelic mutations. It remains to be established whether many of the variants identified in these two genes, so-called unclassified/unknown variants (UVs), contribute to the disease phenotype or are simply neutral variants (or polymorphisms). Given the clinical importance of establishing their status, a nationwide effort to annotate these UVs was launched by laboratories belonging to the French GGC consortium (Groupe Génétique et Cancer), leading to the creation of the UMD-BRCA1/BRCA2 databases (http://www.umd.be/BRCA1/ and http://www.umd.be/BRCA2/). These databases have been endorsed by the French National Cancer Institute (INCa) and are designed to collect all variants detected in France, whether causal, neutral or UV. They differ from other BRCA databases in that they contain co-occurrence data for all variants. Using these data, the GGC French consortium has been able to classify certain UVs also contained in other databases. In this article, we report some novel UVs not contained in the BIC database and explore their impact in cancer predisposition based on a structural approach.