E COLI 23SリボソームRNAの秩序成熟における前駆体配列の役割

リボソームRNA（RRNA）の成熟は、RRNAが機能するために必要な重要ではあるが不完全に理解されているプロセスです。大腸菌で23S rRNAの3 '末端成熟を開始する原因となる酵素を決定するために、3'から5 'のエクソラゼの異なる組み合わせを欠く多くの株を分析しました。これらの分析を通じて、RNase PHを3 '末端成熟の重要なエフェクターとして特定しました。処理反応のさらなる分析により、23S RRNA前駆体には、代わりにRNase Tによって成熟が実行されるのを防ぐCCジヌクレオチド配列が含まれていることが明らかになりました。このジヌクレオチドの変異は成長欠陥をもたらし、RNase T.による早期処理を防ぐために、このRNase T Stallingシーケンスの戦略的意義を示唆しています。RNA処理におけるRNase pHとRNase Tの役割をさらに調査し、転写RNASのサブセットを特定しました。（TRNA）RNase Tストールシーケンスを含み、RNase PH活性がこれらのTRNAを処理するために特に重要であることを示しました。全体として、得られた結果は、23S RRNA処理におけるRNase pHの重要な役割と、細胞内の異なる種のRNA分子の処理におけるこの酵素とRNase Tの間の相互作用を指します。

The maturation of ribosomal RNAs (rRNAs) is an important but incompletely understood process required for rRNAs to become functional. In order to determine the enzymes responsible for initiating 3' end maturation of 23S rRNA in Escherichia coli, we analyzed a number of strains lacking different combinations of 3' to 5' exo-RNases. Through these analyses, we identified RNase PH as a key effector of 3' end maturation. Further analysis of the processing reaction revealed that the 23S rRNA precursor contains a CC dinucleotide sequence that prevents maturation from being performed by RNase T instead. Mutation of this dinucleotide resulted in a growth defect, suggesting a strategic significance for this RNase T stalling sequence to prevent premature processing by RNase T. To further explore the roles of RNase PH and RNase T in RNA processing, we identified a subset of transfer RNAs (tRNAs) that contain an RNase T stall sequence, and showed that RNase PH activity is particularly important to process these tRNAs. Overall, the results obtained point to a key role of RNase PH in 23S rRNA processing and to an interplay between this enzyme and RNase T in the processing of different species of RNA molecules in the cell.