Fonio、Digitaria exilis（Poaceae）の核マイクロサテライトマーカーの開発、西アフリカの穀物が研究されていない

研究の前提：西アフリカで栽培されている研究されていない穀物であるFonio（Digitaria exilis）の遺伝的多様性、集団遺伝的構造、および進化的歴史を探求するための核マイクロサテライトプライマーを開発しました。 方法と結果：マイクロサテライトが豊富なライブラリアプローチを使用して、38の核プライマーペア（31 Di-、5つの三核、および2つのテトラヌクレオチド反復）を分離および特徴付けました。アフリカ。遺伝子座あたりの対立遺伝子の数は2〜22の範囲で、平均4.71で、予想されるヘテロ接合性は0.03から0.93の範囲でした。 結論：21の多型SSRマーカーの開発されたセットは、栽培されたFonioの集団および進化的遺伝学研究のためのツールを提供します。

PREMISE OF THE STUDY: We developed nuclear microsatellite primers to explore the genetic diversity, population genetic structure, and evolutionary history of the fonio (Digitaria exilis), an understudied cereal cultivated in West Africa. METHODS AND RESULTS: We used a microsatellite-enriched library approach to isolate and characterize 38 nuclear primer pairs (31 di-, five tri-, and two tetranucleotide repeats), of which 21 were polymorphic and exhibited a clear pattern in 36 accessions from West Africa. The number of alleles per locus ranged from two to 22, with a mean of 4.71, and expected heterozygosity ranged from 0.03 to 0.93. CONCLUSIONS: The developed set of 21 polymorphic SSR markers will provide tools for population and evolutionary genetics studies of the cultivated fonio.