Bos Taurus y染色体のハプログループへの迅速かつ明確な分類を可能にする新しいUSP9Y多型

ウシUSP9Y遺伝子のイントロン26内で新しいシーケンスタグ付き部位（STS）が特定され、Y2とY3 BOSハプロームをY1から識別できるGenBankアクセッションFJ195366との81塩基対挿入（G.76439_764440INS81）を示しています。さらに、4つのY3固有のシーケンスバリアントにより、ハプログループY2と区別できます。バイソンバイソンy染色体の入力は、USP9Y 81-BP挿入の先祖の対立遺伝子が短いY1バージョンであることを示しています。1230の牛Y染色体の新しいSTSを入力した結果は、標準的な方法を通じて分類と完全に一致しています。新しく識別されたSTSのおかげで、単一のマーカーを使用して現在既知のハプログループに牛y染色体を割り当てることが可能になりました。

A new sequence-tagged site (STS) was identified within intron 26 of the bovine USP9Y gene, showing an 81-base pair insertion (g.76439_76440ins81 in sequence with GenBank accession FJ195366) able to distinguish Y2 and Y3 Bos Y haplogroups from Y1. Moreover, four Y3-specific sequence variants allow a distinction from haplogroup Y2. The typing of a Bison bison Y chromosome indicates that the ancestral allele for the USP9Y 81-bp insertion is the short Y1 version. The results from typing the new STS in 1230 cattle Y chromosomes are fully consistent with their classification through standard methods. Thanks to the newly identified STS, it is now possible to assign cattle Y chromosomes to the currently known haplogroups using a single marker.