ハイペルリドマージンでの生活：チリ、アタカマ砂漠の乾燥土壌における新規細菌の多様性

地球の表面のほぼ半分は、気候変動によって引き起こされる生物学的生産性の低下の影響を受けやすい乾燥地の生態系によって占有されています。これらの領域のうち、植生の半乾燥地域と生物学的に非生産的な過熱ゾーンの間の界面にある乾燥ゾーンは、最も脆弱であると考えられています。この研究の目的は、アタカマ砂漠の植生されていない乾燥土壌で細菌群集の深い多様性分析を実施し、観察された系統発生関連に基づいてこれらのコミュニティの機能的可能性を推測して推測することでした。hyperarid-arid縁にある3つの未植生乾燥部位で454-ピロタグ分析が実施されました。この分析により、多くのバイオームで支配的な、新規アクチノバクテリアとクロロフレシの豊富さと低レベルのアシドバクテリアとプロテオバクテリアが特徴のユニークな細菌の多様性を持つコミュニティが明らかになりました。1つの部位の16S rRNA遺伝子ライブラリーは、亜硝酸塩、一酸化炭素、鉄、または硫黄の酸化によりエネルギーを得ることができる化学療法栄養群との系統発生関連のクローンの存在を明らかにしました。したがって、高乾燥マージンの土壌は、豊富な新規細菌を抱き、系統発生的関連性と生体形成性の生産者と生物地球化学的サイクリングが可能な細菌に潜在的に実行可能なコミュニティをサポートすることがわかった。

Nearly half the earth's surface is occupied by dryland ecosystems, regions susceptible to reduced states of biological productivity caused by climate fluctuations. Of these regions, arid zones located at the interface between vegetated semiarid regions and biologically unproductive hyperarid zones are considered most vulnerable. The objective of this study was to conduct a deep diversity analysis of bacterial communities in unvegetated arid soils of the Atacama Desert, to characterize community structure and infer the functional potential of these communities based on observed phylogenetic associations. A 454-pyrotag analysis was conducted of three unvegetated arid sites located at the hyperarid-arid margin. The analysis revealed communities with unique bacterial diversity marked by high abundances of novel Actinobacteria and Chloroflexi and low levels of Acidobacteria and Proteobacteria, phyla that are dominant in many biomes. A 16S rRNA gene library of one site revealed the presence of clones with phylogenetic associations to chemoautotrophic taxa able to obtain energy through oxidation of nitrite, carbon monoxide, iron, or sulfur. Thus, soils at the hyperarid margin were found to harbor a wealth of novel bacteria and to support potentially viable communities with phylogenetic associations to non-phototrophic primary producers and bacteria capable of biogeochemical cycling.