本質的に無秩序なタンパク質のアルファプロトン検出ベースのバックボーン割り当て

分子内の特定の原子へのNMR共鳴頻度の割り当ては、詳細な構造研究のための重要なステップを確立します。連続的な割り当てのアプローチには、通常、アミドプロトン検出が含まれます。これは、高pHおよび/または温度で本質的に無秩序なタンパク質（IDP）の場合に最適ではない場合があります。ここでは、代替アプローチについて説明します。Alphaプロトン検出されたトリプル共鳴実験に基づく割り当てプロトコルは、アミドプロトン検出に依存する確立された実験よりもいくつかの利点を提供します。私たちの実験は、任意のpHでのIDPの研究に適しており、プロリンリッチセグメントの連続的な割り当てを可能にします。

Assignment of NMR resonance frequencies to a particular atom in the molecule establishes a vital step for any detailed structural study. Approaches for sequential assignment typically involve amide proton detection, which may become suboptimal in case of intrinsically disordered proteins (IDPs) at high pH and/or temperature. Here we describe an alternative approach: assignment protocol based on alpha proton detected triple-resonance experiments, which offer several advantages over well-established experiments relying on amide proton detection. Our experiments are suitable for studies of IDPs at any pH and enable sequential assignment of proline-rich segments.