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Diagnostic microbiology and infectious disease2012Oct01Vol.74issue(2)

ベトナムホーチミン市の3つの病院のサンプル上のCDC A/H1N1PDM09 RT-PCRを使用したCDC A/H1N1PDM09 RT-PCRを使用したRocheリアルタイム対応インフルエンザA/H1N1検出セットの比較

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文献タイプ:
  • Comparative Study
  • Evaluation Study
  • Journal Article
  • Research Support, N.I.H., Extramural
  • Research Support, Non-U.S. Gov't
概要
Abstract

リアルタイムポリメラーゼ連鎖反応(PCR)は、その高感度と特異性のため、インフルエンザウイルスの検出のゴールドスタンダードと見なすことができます。Rocheは、M2遺伝子(M2 PCR)を標的とするPCR A PCRとA/H1N1-PDM09のヘマグルチニン(HA)を標的とする特定のPCR(HA PCR、2009年)を標的とするPCR Aで構成されるリアルタイム対応インフルエンザA/H1N1検出セットを開発しました(HA PCR、2009H1N1)、臨床サンプルで2009 H1N1を検出および定量化するための信頼できる、迅速かつ簡単なテストを行うことを意図しています。このキットは、ベトナムのホーチミン市の3つの大病院で収集された210人の患者から419の鼻と喉のスワブを使用して、インフルエンザウイルスのための疾病管理予防センター(USCDC)/世界保健機関のリアルタイムPCRに対して評価しました。患者ごとの分析では、CDC PCRと比較すると、M2 PCRの感度と特異性はそれぞれ85.8%と97.6%でした。HA PCRの感度と特異性は、それぞれ88.2%と100%でした。サンプルごとの分析では、鼻スワブの感度と特異性は、M2とHA PCRの両方の喉の綿棒の感度よりも高かった。M2およびHA PCRSで決定されたウイルス量は、CDC PCRのCT値とよく相関していました。CDC PCRと比較して、このキットは、インフルエンザAウイルスおよびA/H1N1-PDM09の検出と定量化に対して合理的な感度と非常に良好な特異性を持っています。ただし、2009年のH1N1の現在の状況を考えると、循環するすべての季節性インフルエンザウイルスを検出できるキットが望ましいでしょう。

リアルタイムポリメラーゼ連鎖反応(PCR)は、その高感度と特異性のため、インフルエンザウイルスの検出のゴールドスタンダードと見なすことができます。Rocheは、M2遺伝子(M2 PCR)を標的とするPCR A PCRとA/H1N1-PDM09のヘマグルチニン(HA)を標的とする特定のPCR(HA PCR、2009年)を標的とするPCR Aで構成されるリアルタイム対応インフルエンザA/H1N1検出セットを開発しました(HA PCR、2009H1N1)、臨床サンプルで2009 H1N1を検出および定量化するための信頼できる、迅速かつ簡単なテストを行うことを意図しています。このキットは、ベトナムのホーチミン市の3つの大病院で収集された210人の患者から419の鼻と喉のスワブを使用して、インフルエンザウイルスのための疾病管理予防センター(USCDC)/世界保健機関のリアルタイムPCRに対して評価しました。患者ごとの分析では、CDC PCRと比較すると、M2 PCRの感度と特異性はそれぞれ85.8%と97.6%でした。HA PCRの感度と特異性は、それぞれ88.2%と100%でした。サンプルごとの分析では、鼻スワブの感度と特異性は、M2とHA PCRの両方の喉の綿棒の感度よりも高かった。M2およびHA PCRSで決定されたウイルス量は、CDC PCRのCT値とよく相関していました。CDC PCRと比較して、このキットは、インフルエンザAウイルスおよびA/H1N1-PDM09の検出と定量化に対して合理的な感度と非常に良好な特異性を持っています。ただし、2009年のH1N1の現在の状況を考えると、循環するすべての季節性インフルエンザウイルスを検出できるキットが望ましいでしょう。

Real-time polymerase chain reaction (PCR) can be considered the gold standard for detection of influenza viruses due to its high sensitivity and specificity. Roche has developed the RealTime ready Influenza A/H1N1 Detection Set, consisting of a generic influenza virus A PCR targeting the M2 gene (M2 PCR) and a specific PCR targeting the hemagglutinin (HA) of A/H1N1-pdm09 (HA PCR, 2009 H1N1), with the intention to make a reliable, rapid, and simple test to detect and quantify 2009 H1N1 in clinical samples. We evaluated this kit against the US Centers for Disease Control and Prevention (USCDC)/World Health Organization real-time PCR for influenza virus using 419 nose and throat swabs from 210 patients collected in 3 large hospitals in Ho Chi Minh City, Vietnam. In the per-patient analysis, when compared to CDC PCR, the sensitivity and specificity of the M2 PCR were 85.8% and 97.6%, respectively; the sensitivity and specificity of HA PCR were 88.2% and 100%, respectively. In the per-sample analysis, the sensitivity and specificity in nose swabs were higher than those in throat swabs for both M2 and HA PCRs. The viral loads as determined with the M2 and HA PCRs correlated well with the Ct values of the CDC PCR. Compared with the CDC PCR, the kit has a reasonable sensitivity and very good specificity for the detection and quantification of influenza A virus and A/H1N1-pdm09. However, given the current status of 2009 H1N1, a kit that can detect all circulating seasonal influenza viruses would be preferable.

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