Genalex 65：教育と研究のためのExcel集団遺伝的ソフトウェアにおける遺伝分析 - 更新

概要：Genalex：Excelの遺伝分析は、Microsoft Excel内で実行される集団遺伝子分析のためのクロスプラットフォームパッケージです。Genalexは、二倍体性コドマイナント、半数体およびバイナリ遺伝子遺伝子座およびDNA配列の分析を提供します。周波数ベース（F統計、ヘテロ接合、HWE、人口割り当て、関連性）と距離ベース（AMOVA、PCOA、マントルテスト、多変量空間自己相関）分析の両方が提供されます。新機能には、人口構造の新しい推定器の計算が含まれます：G '（ST）、G' '（ST）、JOST's D（EST）、およびF'（ST）AMOVA、Shannon Information Analysis、Bielelicデータおよび新規のリンケージ不平衡分析空間自己相関分析のための不均一性テスト。他の30を超える他のデータ形式へのエクスポートが提供されます。チュートリアルの指導と段階的な出力オプションの拡張が含まれています。包括的なガイドは完全に改訂されました。 可用性と実装：GenalexはVBAで記述され、Microsoft Excelアドインとして提供されます（Excel 2003、2007、2010 on PC; Excel 2004、2011 Macintoshと互換性があります）。Genalex、およびサポートドキュメントとチュートリアルは、http：//biology.anu.edu.au/genalexで無料で入手できます。 連絡先：rod.peakall@anu.edu.au。

SUMMARY: GenAlEx: Genetic Analysis in Excel is a cross-platform package for population genetic analyses that runs within Microsoft Excel. GenAlEx offers analysis of diploid codominant, haploid and binary genetic loci and DNA sequences. Both frequency-based (F-statistics, heterozygosity, HWE, population assignment, relatedness) and distance-based (AMOVA, PCoA, Mantel tests, multivariate spatial autocorrelation) analyses are provided. New features include calculation of new estimators of population structure: G'(ST), G''(ST), Jost's D(est) and F'(ST) through AMOVA, Shannon Information analysis, linkage disequilibrium analysis for biallelic data and novel heterogeneity tests for spatial autocorrelation analysis. Export to more than 30 other data formats is provided. Teaching tutorials and expanded step-by-step output options are included. The comprehensive guide has been fully revised. AVAILABILITY AND IMPLEMENTATION: GenAlEx is written in VBA and provided as a Microsoft Excel Add-in (compatible with Excel 2003, 2007, 2010 on PC; Excel 2004, 2011 on Macintosh). GenAlEx, and supporting documentation and tutorials are freely available at: http://biology.anu.edu.au/GenAlEx. CONTACT: rod.peakall@anu.edu.au.