Plex-ID™質量分析ミトコンドリアDNAアッセイの検証

非常に挑戦された生物学的サンプルの場合、ミトコンドリアDNA（mtDNA）分析は、より従来の核DNAマーカーが故障した場合にしばしば結果を提供できます。信頼性が高くなりますが、サンガーシーケンスによるmtDNA分析の現在の方法は高価で、労働集約的で、時間がかかり、混合サンプルを定量化できないことで制限されています。Abbott Plex-ID™機器は、エレクトロスプレーイオン化質量分析（ESI-MS）を介したmtDNAアンプリコンの分析を可能にし、サンガーシーケンスに代わる高速で安価な代替品を提供しながら、同等の精度と感度を生成します。サンガーシーケンスとは異なり、このシステムはDNA種を定量化できるため、ヘテロプラスミー、場合によっては混合デコンボリューションを評価するために活用される可能性があります。Plex-ID™mtDNAアッセイの検証研究により、機器が非常に敏感で、再現性のある結果をもたらすことができることが確認されました。フォレンジック環境で一般的に遭遇するサンプル、および人口サンプルは正しくタイプされました。Plex-ID™mtDNAアッセイは、単一ソースサンプルの信頼できる結果をもたらします。これは、現在の方法のそれを満たしているかそれを超えるレベルで、サンガーシーケンスを介して法医学研究所で現在調査されているのと同じサンプルタイプです。機器には混合サンプルを定量化する能力が実証されていますが、mtDNA分析のための特定のアッセイ設計は、キメラmtDNA製品の形成により混合物を分析するために限られた方法でのみ使用できます。

For very challenged biological samples, mitochondrial DNA (mtDNA) analysis can often provide results when the more traditional nuclear DNA markers fail. While reliable, the current method of mtDNA analysis by Sanger sequencing is expensive, labor-intensive, and time-consuming and is limited by its inability to quantify mixed samples. The Abbott PLEX-ID™ instrument, which enables analysis of mtDNA amplicons via electrospray ionization mass spectrometry (ESI-MS), produces comparable accuracy and sensitivity while offering a faster and less expensive alternative to Sanger sequencing. Unlike Sanger sequencing, this system is capable of quantifying DNA species and thus may be exploited for evaluating heteroplasmy and, possibly, mixture deconvolution. Validation studies of the PLEX-ID™ mtDNA assay confirmed that the instrument is highly sensitive and capable of yielding reproducible results. Samples commonly encountered in a forensic setting, as well as population samples, were typed correctly. The PLEX-ID™ mtDNA assay yields reliable results for single-source samples, which are the same sample types currently examined in forensic laboratories via Sanger sequencing, at a level that meets or exceeds that of the current method. While the instrument has the demonstrated capability to quantify mixed samples, the specific assay design for mtDNA analysis can be used only in a limited fashion to analyze mixtures due to the formation of chimeric mtDNA products.