Dermatofibrosarcoma ProtuberansにおけるCol1a1-PDGFB遺伝子融合を検出するための迅速かつ効率的な新たに確立された方法

遺伝分析によるコラーゲン型1α1（COL1A1）および血小板由来の成長因子BB（PDGFB）遺伝子の融合転写産物の検出は、皮膚線維肉腫プロテューベルン（DFSP）の診断のための信頼できる貴重な分子ツールとして認識されています。COL1A1-PDGFB融合を検出するために、ほぼ以前のレポートでは、COL1A1のマルチプレックスフォワードプライマーを使用して逆転写ポリメラーゼ連鎖反応（RT-PCR）を実行しました。ただし、手順における複数のプライマーと試薬の取り扱いに関して、技術的な困難があります。この研究の目的は、単一のプライマーペアのみを使用してPCRの迅速で簡単で効率的なワンステップ方法を確立して、DFSPのCol1a1とPDGFBの融合転写産物を検出することです。新しい方法を検証するために、Multiplex Primersを使用して以前の方法の間でDFSPの5人の患者のRT-PCRの結果を、単一のプライマーペアを使用して確立されたワンステップRT-PCRを比較しました。DFSPのすべての場合において、COL1A1-PDGFB融合は、以前の方法と新しく確立されたワンステップPCRの両方で検出されました。重要なことに、Exon 5で新しいCol1a1ブレークポイントを検出しました。新しく開発された方法は、DFSPのCol1a1-PDGFB融合転写産物を迅速に識別するために価値があります。

The detection of fusion transcripts of the collagen type 1α1 (COL1A1) and platelet-derived growth factor-BB (PDGFB) genes by genetic analysis has recognized as a reliable and valuable molecular tool for the diagnosis of dermatofibrosarcoma protuberans (DFSP). To detect the COL1A1-PDGFB fusion, almost previous reports performed reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) using multiplex forward primers from COL1A1. However, it has possible technical difficulties with respect to the handling of multiple primers and reagents in the procedure. The objective of this study is to establish a rapid, easy, and efficient one-step method of PCR using only a single primer pair to detect the fusion transcripts of the COL1A1 and PDGFB in DFSP. To validate new method, we compared the results of RT-PCR in five patients of DFSP between the previous method using multiplex primers and our established one-step RT-PCR using a single primer pair. In all cases of DFSP, the COL1A1-PDGFB fusion was detected by both previous method and newly established one-step PCR. Importantly, we detected a novel COL1A1 breakpoint in exon 5. The newly developed method is valuable to rapidly identify COL1A1-PDGFB fusion transcripts in DFSP.