4Q欠失症候群の遺伝子型 - 表現型分析：重要な領域の提案

染色体4Q欠失症候群（4Q-症候群）はまれな状態であり、100,000分の1の発生率が推定されています。変数ですが、臨床スペクトルには一般に、頭蓋顔面、発達、デジタル、骨格、および心臓の関与が含まれます。4Qアーム内の遺伝子型と表現型の相関に関するデータは限られています。4Q欠失のある20人の患者に関するアレイCGHによる詳細な臨床情報および遺伝情報を提示します。4Q35.1で、4Q35.1で約465 kbの削除（186,770,069-187,234,800、HG18座標）を持つ患者を特定しました。発達遅延を除き、4Q欠失症候群のすべての臨床的特徴は、これがこの状態と特定の遺伝子の重要な領域であることを示唆しています。口腔顔面の裂け目と先天性心臓の欠陥の責任は、この地域に存在します。末端欠失を有する患者はすべて口蓋裂を持っていたため、我々の結果は、裂け目に関連する遺伝子が4Qの末端セグメントにあるというさらなる証拠を提供します。患者の遺伝的情報と臨床的特徴を比較対照することにより、特定の表現型を個々の遺伝子にリンクする単一の遺伝子レベルで重要な遺伝子型表現型の相関を発見しました。これらのデータに基づいて、BMP3、SEC31A、MAPK10、SPARCL1、DMP1、IBSP、PKD2、GRID2、PITX2、NEUG2、ANK2、FGF2、HAND2、およびDUX4ジェネルを含む染色体4Qの仮想部分表現型ジェノタイプMAPを構築しました。

Chromosome 4q deletion syndrome (4q- syndrome) is a rare condition, with an estimated incidence of 1 in 100,000. Although variable, the clinical spectrum commonly includes craniofacial, developmental, digital, skeletal, and cardiac involvement. Data on the genotype-phenotype correlation within the 4q arm are limited. We present detailed clinical and genetic information by array CGH on 20 patients with 4q deletions. We identified a patient who has a ∼465 kb deletion (186,770,069-187,234,800, hg18 coordinates) in 4q35.1 with all clinical features for 4q deletion syndrome except for developmental delay, suggesting that this is a critical region for this condition and a specific gene responsible for orofacial clefts and congenital heart defects resides in this region. Since the patients with terminal deletions all had cleft palate, our results provide further evidence that a gene associated with clefts is located on the terminal segment of 4q. By comparing and contrasting our patients' genetic information and clinical features, we found significant genotype-phenotype correlations at a single gene level linking specific phenotypes to individual genes. Based on these data, we constructed a hypothetical partial phenotype-genotype map for chromosome 4q which includes BMP3, SEC31A, MAPK10, SPARCL1, DMP1, IBSP, PKD2, GRID2, PITX2, NEUROG2, ANK2, FGF2, HAND2, and DUX4 genes.