ヒト血小板由来の成長因子受容体βプロモーターで形成された主要なG四重鎖は、K+溶液に新規壊れた鎖構造を採用しています

血小板由来成長因子受容体β（PDGFR-β）の過剰発現は、癌および血管障害および線維性障害に関連しています。PDGFR-βは、癌および線維性障害の治療の魅力的な標的となっています。ヒトPDGFR-β遺伝子プロモーターのGCリッチヌクレアーゼ過敏症性要素で形成されたDNA G Quadruplexは、PDGFR-β転写活性を阻害することがわかっています。ここでは、PDGFR-βプロモーターで形成された主要なG Quadruplexを決定しました。3つ以上のグアニンを使用して4つの連続走行を使用する代わりに、このg-quadruplexは、壊れたG鎖を備えた新規折り畳みを採用して、主に平行した鎖の内分子構造を形成し、3つのヌクレオチド（NT）二重鎖反転ループと1つを形成します。追加のラテラルループ。PDGFR-βプロモーターG-Quadruplexの新規折りたたみは、1 ntループを持つ平行鎖構造モチーフの堅牢性を強調しています。遺伝子プロモーター配列で形成されたg-quadruplexの最近の進歩を考慮して、1 ntループG（i）ng（j）モチーフは、プロモーターG四重鎖が構築できる安定した基礎として機能するように進化的に選択された可能性があります。PDGFR-βプロモーターG-Quadruplexの新規折りたたみは、この二次構造を標的にし、PDGFR-β遺伝子発現を調節する小分子薬にとって魅力的かもしれません。

Overexpression of platelet-derived growth factor receptor β (PDGFR-β) has been associated with cancers and vascular and fibrotic disorders. PDGFR-β has become an attractive target for the treatment of cancers and fibrotic disorders. DNA G-quadruplexes formed in the GC-rich nuclease hypersensitivity element of the human PDGFR-β gene promoter have been found to inhibit PDGFR-β transcriptional activity. Here we determined the major G-quadruplex formed in the PDGFR-β promoter. Instead of using four continuous runs with three or more guanines, this G-quadruplex adopts a novel folding with a broken G-strand to form a primarily parallel-stranded intramolecular structure with three 1 nucleotide (nt) double-chain-reversal loops and one additional lateral loop. The novel folding of the PDGFR-β promoter G-quadruplex emphasizes the robustness of parallel-stranded structural motifs with a 1 nt loop. Considering recent progress on G-quadruplexes formed in gene-promoter sequences, we suggest the 1 nt looped G(i)NG(j) motif may have been evolutionarily selected to serve as a stable foundation upon which the promoter G-quadruplexes can build. The novel folding of the PDGFR-β promoter G-quadruplex may be attractive for small-molecule drugs that specifically target this secondary structure and modulate PDGFR-β gene expression.