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The journal of physical chemistry. A2013Feb14Vol.117issue(6)

気相におけるヨウ素標識ペプチドとタンパク質の紫外線作用分光法

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文献タイプ:
  • Journal Article
  • Research Support, Non-U.S. Gov't
  • Research Support, U.S. Gov't, Non-P.H.S.
概要
Abstract

気相における大きな生体分子の構造調査は困難です。ここでは、容易なカーボン - ヨウ素結合を利用する作用分光法を使用して、タンパク質全体を含む大きな分子の構造を調べることができることが報告されています。ヨードチロシンは活性発色団として機能し、分子の残りの部分によって側鎖の溶媒和に応じて特徴的なスペクトルをもたらします。発色団の分離は、〜290 nmで二重特徴のピークをもたらし、溶媒和の増加とともに単一のピークになります。サイドチェーンの脱プロトン化は、明らかな強度の低下とアクションスペクトルの拡大にもつながります。この方法は、さまざまな電荷状態で負の帯電イオンの両方に正常に適用できますが、電子剥離は荷電アニオンを増やすための競争チャネルになります。他のすべてのケースでは、ヨウ素の喪失は、高感度と単純なデータ分析につながる主要なチャネルです。ヨードチロシン、ヨウ素化ペプチドkgydaka、dayldag、および小さなタンパク質ユビキチンの作用スペクトルは、さまざまな電荷状態で報告されています。

気相における大きな生体分子の構造調査は困難です。ここでは、容易なカーボン - ヨウ素結合を利用する作用分光法を使用して、タンパク質全体を含む大きな分子の構造を調べることができることが報告されています。ヨードチロシンは活性発色団として機能し、分子の残りの部分によって側鎖の溶媒和に応じて特徴的なスペクトルをもたらします。発色団の分離は、〜290 nmで二重特徴のピークをもたらし、溶媒和の増加とともに単一のピークになります。サイドチェーンの脱プロトン化は、明らかな強度の低下とアクションスペクトルの拡大にもつながります。この方法は、さまざまな電荷状態で負の帯電イオンの両方に正常に適用できますが、電子剥離は荷電アニオンを増やすための競争チャネルになります。他のすべてのケースでは、ヨウ素の喪失は、高感度と単純なデータ分析につながる主要なチャネルです。ヨードチロシン、ヨウ素化ペプチドkgydaka、dayldag、および小さなタンパク質ユビキチンの作用スペクトルは、さまざまな電荷状態で報告されています。

Structural investigations of large biomolecules in the gas phase are challenging. Herein, it is reported that action spectroscopy taking advantage of facile carbon-iodine bond dissociation can be used to examine the structures of large molecules, including whole proteins. Iodotyrosine serves as the active chromophore, which yields distinctive spectra depending on the solvation of the side chain by the remainder of the molecule. Isolation of the chromophore yields a double featured peak at ~290 nm, which becomes a single peak with increasing solvation. Deprotonation of the side chain also leads to reduced apparent intensity and broadening of the action spectrum. The method can be successfully applied to both negatively and positively charged ions in various charge states, although electron detachment becomes a competitive channel for multiply charged anions. In all other cases, loss of iodine is by far the dominant channel which leads to high sensitivity and simple data analysis. The action spectra for iodotyrosine, the iodinated peptides KGYDAKA, DAYLDAG, and the small protein ubiquitin are reported in various charge states.

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