IMGT（®）データベースと抗体工学と人間化のためのツールの使用

IMGT（®）、国際免疫遺伝子情報システム（®）（http://www.imgt.org）は、1989年に抗原受容体、免疫グロブリン（Ig）または抗体、およびT細胞受容体の膨大な多様性を管理するために作成されました。（TR）。IMGT（®）データベースとツールを使用した抗体の標準化された配列と構造分析により、抗体配列と3次元（3D）構造の間のギャップを初めてブリッジできます。これは、IMGT分類の分類概念（IMGT遺伝子と対立遺伝子の命名法）、説明（IMGT標準化されたラベル）、および数値化（IMGTユニークな番号とIMGTコリアーde Perles）に基づいて、IMGT科学チャートルールを通じて達成されます。IMGT（®）は、免疫遺伝学および免疫情報学の国際的な参照であり、その基準は抗体のヒト化と免疫原性の評価に特に役立ちます。抗体ヌクレオチド配列および遺伝子のIMGT（®）データベースにはそれぞれIMGT/LIGM-DBおよびIMGT/遺伝子-DBが含まれますが、ヌクレオチド配列分析はIMGT/Vクエスト、IMGT/HighV-Quest、およびIMGT/JunctionAnalysysysysysysysによって実行されます。ツール。この章では、アミノ酸配列、2次元（2D）および3次元（3D）構造のIMGT（®）データベースとツールに焦点を当てています。/2DSTRUCTURE -DBデータベースモノクローナル抗体のアミノ酸配列（MAB、接尾辞-MAB）および世界保健機関/国際非専用名（WHO/INN）プログラムおよびその他のタンパク質の免疫用途向けの融合タンパク質（FPIA、接尾辞 - 受容）興味深いのは、結晶化抗体およびその関連するツールのIMGT/3DStructure-DBデータベース（IMGT/StructuralQuery、IMGT/DomainsSuperimpose）。

IMGT(®), the international ImMunoGeneTics information system(®) (http://www.imgt.org), was created in 1989 to manage the huge diversity of the antigen receptors, immunoglobulins (IG) or antibodies, and T cell receptors (TR). Standardized sequence and structure analysis of antibody using IMGT(®) databases and tools allows one to bridge, for the first time, the gap between antibody sequences and three-dimensional (3D) structures. This is achieved through the IMGT Scientific chart rules, based on the IMGT-ONTOLOGY concepts of classification (IMGT gene and allele nomenclature), description (IMGT standardized labels), and numerotation (IMGT unique numbering and IMGT Colliers de Perles). IMGT(®) is the international reference for immunogenetics and immunoinformatics and its standards are particularly useful for antibody humanization and evaluation of immunogenicity. IMGT(®) databases for antibody nucleotide sequences and genes include IMGT/LIGM-DB and IMGT/GENE-DB, respectively, whereas nucleotide sequence analysis is performed by the IMGT/V-QUEST, IMGT/HighV-QUEST, and IMGT/JunctionAnalysis tools. In this chapter, we focus on IMGT(®) databases and tools for amino acid sequences, two-dimensional (2D) and three-dimensional (3D) structures: the IMGT/DomainGapAlign and IMGT/Collier-de-Perles tools, the IMGT/2Dstructure-DB database for amino acid sequences of monoclonal antibodies (mAb, suffix -mab) and fusion proteins for immune applications (FPIA, suffix -cept) of the World Health Organization/International Nonproprietary Name (WHO/INN) programme and other proteins of interest, and the IMGT/3Dstructure-DB database for crystallized antibodies and its associated tools (IMGT/StructuralQuery, IMGT/DomainSuperimpose).