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Journal of computer-aided molecular design2012Sep01Vol.26issue(9)

Pseudomonas aeruginosaのLASRおよびRHLR受容体タンパク質に対する推定クォーラムセンシング阻害剤の計算発見

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文献タイプ:
  • Journal Article
  • Research Support, Non-U.S. Gov't
概要
Abstract

薬物は、主に従来の救済策からの活性成分の識別または予測されていない発見によって、過去に発見されてきました。構造に基づいた仮想スクリーニングの研究の重要な動機は、標的薬を設計するためのそのような情報の搾取です。この研究では、構造ベースの仮想スクリーニングを使用して、緑膿菌の推定クォーラムセンシング阻害剤(QSI)を検索しました。仮想スクリーニングプログラムグライドバージョン5.5は、緑膿菌のLASRおよびRHLR受容体タンパク質に対するスクリーニング1,920天然化合物/薬物に適用されました。インシリコドッキング分析の結果に基づいて、5つのトップランキング化合物、すなわちロスマリン酸、ナリン酸、クロロゲン酸、モリン、およびマンギファリンは、実験室株PAO1と2つの抗生物質耐性臨床分離株、P。AeruginosaAS1(GU447237)とP. aeruginosaに対してin vitroバイオアッセイにさらされました。研究された5つの化合物のうち、他の4つの化合物を除く、他の4つの化合物を除き、プロテアーゼ、エラスターゼ、ヘモリシンの産生に有意な阻害が示されました。さらに、5つの化合物すべてが、バイオフィルム関連の行動を潜在的に阻害する可能性があります。この相互作用研究は、緑膿菌におけるクォーラムセンシング(QS)媒介性毒性因子産生を阻害する有望なリガンドを提供しました。

薬物は、主に従来の救済策からの活性成分の識別または予測されていない発見によって、過去に発見されてきました。構造に基づいた仮想スクリーニングの研究の重要な動機は、標的薬を設計するためのそのような情報の搾取です。この研究では、構造ベースの仮想スクリーニングを使用して、緑膿菌の推定クォーラムセンシング阻害剤(QSI)を検索しました。仮想スクリーニングプログラムグライドバージョン5.5は、緑膿菌のLASRおよびRHLR受容体タンパク質に対するスクリーニング1,920天然化合物/薬物に適用されました。インシリコドッキング分析の結果に基づいて、5つのトップランキング化合物、すなわちロスマリン酸、ナリン酸、クロロゲン酸、モリン、およびマンギファリンは、実験室株PAO1と2つの抗生物質耐性臨床分離株、P。AeruginosaAS1(GU447237)とP. aeruginosaに対してin vitroバイオアッセイにさらされました。研究された5つの化合物のうち、他の4つの化合物を除く、他の4つの化合物を除き、プロテアーゼ、エラスターゼ、ヘモリシンの産生に有意な阻害が示されました。さらに、5つの化合物すべてが、バイオフィルム関連の行動を潜在的に阻害する可能性があります。この相互作用研究は、緑膿菌におけるクォーラムセンシング(QS)媒介性毒性因子産生を阻害する有望なリガンドを提供しました。

Drugs have been discovered in the past mainly either by identification of active components from traditional remedies or by unpredicted discovery. A key motivation for the study of structure based virtual screening is the exploitation of such information to design targeted drugs. In this study, structure based virtual screening was used in search for putative quorum sensing inhibitors (QSI) of Pseudomonas aeruginosa. The virtual screening programme Glide version 5.5 was applied to screen 1,920 natural compounds/drugs against LasR and RhlR receptor proteins of P. aeruginosa. Based on the results of in silico docking analysis, five top ranking compounds namely rosmarinic acid, naringin, chlorogenic acid, morin and mangiferin were subjected to in vitro bioassays against laboratory strain PAO1 and two more antibiotic resistant clinical isolates, P. aeruginosa AS1 (GU447237) and P. aeruginosa AS2 (GU447238). Among the five compounds studied, except mangiferin other four compounds showed significant inhibition in the production of protease, elastase and hemolysin. Further, all the five compounds potentially inhibited the biofilm related behaviours. This interaction study provided promising ligands to inhibit the quorum sensing (QS) mediated virulence factors production in P. aeruginosa.

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