膜タンパク質TMセグメントは、統合中にトランスロコンで、初期鎖がバルク脂質にフレット検出された放出をキューするまで保持されます

ほとんどの膜タンパク質は、非極性新生タンパク質膜貫通セグメント（TMS）が非極性膜内部に直接分割すると広く信じられているトランスコンのER膜に同時統合されています。しかし、蛍光標識TMSとバルク脂質に拡散する蛍光リン脂質の分離を監視するFRETアプローチは、TMSが膜の脂質相にすぐに入ることがないことを明らかにしています。代わりに、TMSは、バルク脂質への放出が翻訳終了によってトリガーされるまで、または場合によっては、トランスロコンに別の新生鎖TMSが到着することによりトリガーされるまで、タンパク質間相互作用によってトランスロコンで保持されます。したがって、初期の鎖の状態と構造要素は、TMS、リボソーム、および関連タンパク質とのTMSと隣接配列の相互作用を変化させることにより、TMSのタイミングを脂質相へのタイミングを決定し、それにより、連続したTMSが二重層およびTMS誘導ループに組み立てたときに制御します。

Most membrane proteins are integrated cotranslationally into the ER membrane at the translocon, where nonpolar nascent protein transmembrane segments (TMSs) are widely believed to partition directly into the nonpolar membrane interior. However, a FRET approach that monitors the separation between a fluorescent-labeled TMS and fluorescent phospholipids diffusing in the bulk lipid reveals that TMSs do not immediately enter the lipid phase of the membrane. Instead, TMSs are retained at the translocon by protein-protein interactions until their release into bulk lipid is triggered by translation termination or, in some cases, by the arrival of another nascent chain TMS at a translocon. Nascent chain status and structural elements therefore dictate the timing of TMS release into the lipid phase by altering TMS and flanking sequence interactions with translocons, ribosomes, and associated proteins, thereby controlling when successive TMSs assemble in the bilayer and TMS-delineated loops fold.