DNAトリプルヘリックスによるECORI制限/修飾酵素の部位固有の阻害

オリゴピリミジンがトリプルヘリックス形成を通じて、ECORI制限および修飾酵素（ECORIおよびMECORI）の特定のタンパク質DNA相互作用を認識配列（GAATTC）と阻害する能力を研究しました。オリゴヌクレオチド（CTT）4および（CTT）8は、ECORI部位を含む（GAA）nリピートでプラスミドにトリプレックスを形成しました。これらの配列内のECORI部位の切断とメチル化は、オリゴヌクレオチドによって特異的に阻害されましたが、A（GAA）N配列に隣接するECORI部位は阻害されませんでした。また、プラスミド内の他のECORI部位、または外因的に添加されたラムダDNAには、阻害されませんでした。これらの結果は、トリックス形成オリゴヌクレオチドを使用して特定の部位でのタンパク質DNA相互作用をブロックする可能性を示しているため、この手法は染色体マッピングと遺伝子発現の変調に役立つ可能性があります。

The ability of oligopyrimidines to inhibit, through triple helix formation, the specific protein-DNA interactions of the EcoRI restriction and modification enzymes (EcoRI and MEcoRI) with their recognition sequence (GAATTC) was studied. The oligonucleotides (CTT)4 and (CTT)8 formed triplexes in plasmids at (GAA)n repeats containing EcoRI sites. Cleavage and methylation of EcoRI sites within these sequences were specifically inhibited by the oligonucleotides, whereas an EcoRI site adjacent to a (GAA)n sequence was inhibited much less. Also, other EcoRI sites within the plasmid, or in exogenously added lambda DNA, were not inhibited. These results demonstrate the potential of using triplex-forming oligonucleotides to block protein-DNA interactions at specific sites, and thus this technique may be useful in chromosome mapping and in the modulation of gene expression.