Loading...
Journal of clinical microbiology2013Jan01Vol.51issue(1)

Candida guilliermondiiおよびカンジダの他の種は、カンジダファマタと誤認されました:Vitek 2、DNAシーケンス分析、および2つのグローバル抗真菌監視プログラムにおける飛行質量分析のマトリックス支援レーザー脱離イオン化時間による評価

,
,
,
,
,
文献タイプ:
  • Evaluation Study
  • Journal Article
  • Research Support, Non-U.S. Gov't
概要
Abstract

Candida famata(Teleomorph debaryomyces hansenii)は医学的に関連する酵母として説明されており、この種は現在臨床研究所で使用されている多くの商業識別システムに含まれています。セントリーおよびアルテミスの監視プログラム中に収集された53の株のうち、さまざまな商業的方法(Vitek、Microscan、API、およびAuxacolor)によってC. famata(この識別を含むすべての提出株を含む)として以前に特定された53株のうち、DNAシーケンス方法は19が19であることを示しました。株はC. guilliermondii、14はC. parapsilosis、5はC. lusitaniae、4はC. albicans、3はC. tropicalisであり、5つの分離株は他のカンジダ種に属していました(2つのC. fermentatiと1つのC. intermedia、C。pelliculosa、およびPichia fabianni)。さらに、3つの誤認されたC. famata株は、遺伝子間転写スペーサー(ITS)および/または遺伝子間スペーサー(IGS)シーケンスを使用して、Kodomaea ohmeri、debaryomyces nepalensis、およびdebaryomyces fabryiとして正しく特定されました。Vitek 2システムは、C。famataとC. famataとC. guilliermondiiまたはC. parapsilosisの間で信頼性が低いと自信が高い3つの分離株を特定し、DNAシーケンス結果と56.6%の一致しか表示されませんでした。Matrix-Assistedレーザー脱離イオン化イオン化時間(MALDI-TOF)結果は、DNAシーケンスと81.1%の一致を示しました。C.メタプシロシス、C。fermentati、およびC. intermediaのそれぞれの株は、Maldi Biotyperの識別のための低スコア(<2.0)を示しました。K. Ohmeri、D。Nepalensis、およびD. Fabryiは、この研究でDNAシーケンスによって特定されたことは、Maldi Biotyperの現在のデータベースには含まれていませんでした。これらの結果は、真菌感染症でのC. famataの発生が以前に評価されたよりもはるかに低く、商用システムが新しく導入されたMaldi-TOF機器を除いて正確な識別を生成しないことを示唆しています。

Candida famata(Teleomorph debaryomyces hansenii)は医学的に関連する酵母として説明されており、この種は現在臨床研究所で使用されている多くの商業識別システムに含まれています。セントリーおよびアルテミスの監視プログラム中に収集された53の株のうち、さまざまな商業的方法(Vitek、Microscan、API、およびAuxacolor)によってC. famata(この識別を含むすべての提出株を含む)として以前に特定された53株のうち、DNAシーケンス方法は19が19であることを示しました。株はC. guilliermondii、14はC. parapsilosis、5はC. lusitaniae、4はC. albicans、3はC. tropicalisであり、5つの分離株は他のカンジダ種に属していました(2つのC. fermentatiと1つのC. intermedia、C。pelliculosa、およびPichia fabianni)。さらに、3つの誤認されたC. famata株は、遺伝子間転写スペーサー(ITS)および/または遺伝子間スペーサー(IGS)シーケンスを使用して、Kodomaea ohmeri、debaryomyces nepalensis、およびdebaryomyces fabryiとして正しく特定されました。Vitek 2システムは、C。famataとC. famataとC. guilliermondiiまたはC. parapsilosisの間で信頼性が低いと自信が高い3つの分離株を特定し、DNAシーケンス結果と56.6%の一致しか表示されませんでした。Matrix-Assistedレーザー脱離イオン化イオン化時間(MALDI-TOF)結果は、DNAシーケンスと81.1%の一致を示しました。C.メタプシロシス、C。fermentati、およびC. intermediaのそれぞれの株は、Maldi Biotyperの識別のための低スコア(<2.0)を示しました。K. Ohmeri、D。Nepalensis、およびD. Fabryiは、この研究でDNAシーケンスによって特定されたことは、Maldi Biotyperの現在のデータベースには含まれていませんでした。これらの結果は、真菌感染症でのC. famataの発生が以前に評価されたよりもはるかに低く、商用システムが新しく導入されたMaldi-TOF機器を除いて正確な識別を生成しないことを示唆しています。

Candida famata (teleomorph Debaryomyces hansenii) has been described as a medically relevant yeast, and this species has been included in many commercial identification systems that are currently used in clinical laboratories. Among 53 strains collected during the SENTRY and ARTEMIS surveillance programs and previously identified as C. famata (includes all submitted strains with this identification) by a variety of commercial methods (Vitek, MicroScan, API, and AuxaColor), DNA sequencing methods demonstrated that 19 strains were C. guilliermondii, 14 were C. parapsilosis, 5 were C. lusitaniae, 4 were C. albicans, and 3 were C. tropicalis, and five isolates belonged to other Candida species (two C. fermentati and one each C. intermedia, C. pelliculosa, and Pichia fabianni). Additionally, three misidentified C. famata strains were correctly identified as Kodomaea ohmeri, Debaryomyces nepalensis, and Debaryomyces fabryi using intergenic transcribed spacer (ITS) and/or intergenic spacer (IGS) sequencing. The Vitek 2 system identified three isolates with high confidence to be C. famata and another 15 with low confidence between C. famata and C. guilliermondii or C. parapsilosis, displaying only 56.6% agreement with DNA sequencing results. Matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight (MALDI-TOF) results displayed 81.1% agreement with DNA sequencing. One strain each of C. metapsilosis, C. fermentati, and C. intermedia demonstrated a low score for identification (<2.0) in the MALDI Biotyper. K. ohmeri, D. nepalensis, and D. fabryi identified by DNA sequencing in this study were not in the current database for the MALDI Biotyper. These results suggest that the occurrence of C. famata in fungal infections is much lower than previously appreciated and that commercial systems do not produce accurate identifications except for the newly introduced MALDI-TOF instruments.

医師のための臨床サポートサービス

ヒポクラ x マイナビのご紹介

無料会員登録していただくと、さらに便利で効率的な検索が可能になります。

Translated by Google