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カナダのモントリオールバイオドームで海水を処理するメタノール給電システムから、JAM1(T)とJAM7(T)と指定された2つの細菌株を分離しました。それらは、16S rRNA遺伝子配列の分析により、ガマプロテオバクテリアのメチロファガ属内に所属していました。JAM1株(T)は、硝酸塩をメチロファガ属の種の中でユニークな亜硝酸塩に減らすことにより、脱窒条件下で成長する能力を持っていました。主要な脂肪酸は、C16:1Ω7Cまたはω6C、C16:0およびC18:1Ω7Cまたはω6Cでした。主要なユビキノンはQ8でした。両方の株には、成長にビタミンB12とNa(+)イオンが必要でした。株のゲノムJAM1(T)とJAM7(T)は完全に配列決定されており、それぞれ44.7 mol%と47.8 mol%のDNA G+C含有量が示されています。成長はpH 6-11および0.5-8%NaClで発生しました。両方のゲノムには、リブロース単リン酸経路の重要な酵素をコードする予測ORFが含まれていました。また、2つの硝酸レダクターゼ(NAR)、2つの一酸化窒素還元酵素(NOR)、1つの亜酸化窒素還元酵素(NOS)、1つの切り捨てられた亜硝酸還元酵素(NIRK)をコードするオペロンは、株JAM1(T)の67 KB染色体領域でクラスター化されました。そのようなオペロンは、jam7株(t)で見つかりませんでした。これらの結果は、メチロファガ属内の新規種としての2つの株の所属を支持しました。名前の名前硝化窒化症sp。11月。タイプ株Jam1(t)(= DSM 25689(T)= ATCC BAA-2433(t))およびMethylophaga frappieri sp。11月。型ひずみJAM7(T)(= DSM 25690(T)= ATCC BAA-2434(T))が提案されています。
カナダのモントリオールバイオドームで海水を処理するメタノール給電システムから、JAM1(T)とJAM7(T)と指定された2つの細菌株を分離しました。それらは、16S rRNA遺伝子配列の分析により、ガマプロテオバクテリアのメチロファガ属内に所属していました。JAM1株(T)は、硝酸塩をメチロファガ属の種の中でユニークな亜硝酸塩に減らすことにより、脱窒条件下で成長する能力を持っていました。主要な脂肪酸は、C16:1Ω7Cまたはω6C、C16:0およびC18:1Ω7Cまたはω6Cでした。主要なユビキノンはQ8でした。両方の株には、成長にビタミンB12とNa(+)イオンが必要でした。株のゲノムJAM1(T)とJAM7(T)は完全に配列決定されており、それぞれ44.7 mol%と47.8 mol%のDNA G+C含有量が示されています。成長はpH 6-11および0.5-8%NaClで発生しました。両方のゲノムには、リブロース単リン酸経路の重要な酵素をコードする予測ORFが含まれていました。また、2つの硝酸レダクターゼ(NAR)、2つの一酸化窒素還元酵素(NOR)、1つの亜酸化窒素還元酵素(NOS)、1つの切り捨てられた亜硝酸還元酵素(NIRK)をコードするオペロンは、株JAM1(T)の67 KB染色体領域でクラスター化されました。そのようなオペロンは、jam7株(t)で見つかりませんでした。これらの結果は、メチロファガ属内の新規種としての2つの株の所属を支持しました。名前の名前硝化窒化症sp。11月。タイプ株Jam1(t)(= DSM 25689(T)= ATCC BAA-2433(t))およびMethylophaga frappieri sp。11月。型ひずみJAM7(T)(= DSM 25690(T)= ATCC BAA-2434(T))が提案されています。
Two bacterial strains, designated JAM1(T) and JAM7(T), were isolated from a methanol-fed denitrification system treating seawater at the Montreal Biodome, Canada. They were affiliated within the genus Methylophaga of the Gammaproteobacteria by analysis of the 16S rRNA gene sequences. Strain JAM1(T) had the capacity to grow under denitrifying conditions by reducing nitrate into nitrite which is unique among the species of the genus Methylophaga. Major fatty acids were C16:1ω7c or ω6c, C16:0 and C18:1ω7c or ω6c. The major ubiquinone was Q8. Both strains required vitamin B12 and Na(+) ions for growth. The genomes of strains JAM1(T) and JAM7(T) have been completely sequenced and showed a DNA G+C content of 44.7 mol% and 47.8 mol%, respectively. Growth occurred at pH 6-11 and at 0.5-8% NaCl. Both genomes contained predicted ORFs encoding the key enzymes of the ribulose monophosphate pathway. Also, operons encoding two nitrate reductases (Nar), two nitric oxide reductases (Nor), one nitrous oxide reductase (Nos) and one truncated nitrite reductase (NirK) were clustered in a 67 kb chromosomal region in strain JAM1(T). No such operons were found in strain JAM7(T). These results supported the affiliation of the two strains as novel species within the genus Methylophaga. The names Methylophaga nitratireducenticrescens sp. nov. for type strain JAM1(T) (=DSM 25689(T)=ATCC BAA-2433(T)) and Methylophaga frappieri sp. nov. for type strain JAM7(T) (=DSM 25690(T)=ATCC BAA-2434(T)) are proposed.
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