ダイサー加工された小さなRNA：ルールと例外

標準的なマイクロRNAは、Dicerによってヘアピン型の前駆体から切除されます。この規則の可能な例外を見つけ、ダイサー処理のための追加の基質を特定するために、Friedländeretal。[Friedländeretal。、2012、核酸Res 40：37-52]。よく知られている非干渉者miR-451はこれらの実験では十分に発現していませんが、いくつかの追加のダイサーに依存しないマイクロRNAがあり、その中には重要な腫瘍サプレッサーmiR-663aがあります。TRNA-Glnやいくつかの竜などの非miRNAダイサー基質の以前に説明した例を回復します。興味深いことに、Box C/D Snornasから派生したSDRNAはディサーに依存しませんが、Box H/ACA Snornasから派生したSdrnaはしばしばダイサーに依存します。いくつかのPol-III転写産物、特にボールトRNAと類人猿特異的な周sarはダイサーによって処理されますが、Y RNAに由来する小さなRNAはダイカーに依存しないようです。

Canonical microRNAs are excised from their hairpin-shaped precursors by Dicer. In order to find possible exceptions to this rule and to identify additional substrates for Dicer processing we re-evaluate the small RNA sequencing data of the Dicer knockdown experiment in MCF-7 cells orignally published by Friedländer et al. [Friedländer et al., 2012, Nucleic Acids Res 40:37-52]. While the well-known non-Dicer mir-451 is not sufficiently expressed in these experiments, there are several additional Dicer-independent microRNAs, among them the important tumor supressor mir-663a. We recover previously described examples of non-miRNA Dicer substrates such as tRNA-Gln and several snoRNAs. Interestingly, sdRNAs derived from box C/D snoRNAs are Dicer-independent, while those derived from box H/ACA snoRNAs are often Dicer dependent. Several pol-III transcripts, in particular the vault RNAs and the great ape specific snaRs are processed by Dicer, while the small RNAs originating from Y RNAs seem to be Dicer independent.