スプライシングに対するまれなバリアントの影響の分析は、自閉症スペクトラム障害の個体におけるGABAA受容体遺伝子の変化を特定します

2つの一般的な神経発達障害である自閉症スペクトラム障害（ASD）または統合失調症（SCZ）を持つ個人におけるX連鎖シナプス遺伝子の大規模なシーケンススクリーンは、遺伝子機能に容易に予測可能な効果を持たない多くのバリアントを特定しました。このレポートでは、遺伝子スプライシングに対するこれらのまれなミスセンスとサイレントバリアントの影響を評価しました。この目的のために、これらの変異を有する患者に由来するリンパ芽球細胞から調製したin vitroミニゲンベースのアッセイと、in vitroミニゲンベースのアッセイとRNAを補完するシリコ分析で補完的なものを使用しました。私たちの目標は、アクセプタースプライス部位、ドナースプライス部位、またはエクソンスプライシングエンハンサーを作成または混乱させる可能性のあるバリアントを特定することであり、ASDまたはSCZの病因に関与する可能性のある異常なスプライシングにつながることでした。2つの異なるファミリーにおいて、異なるX結合ガンマアミノ酪酸A（GABAA）受容体サブユニットエンコード遺伝子GABRQおよびGABRA3の切り捨て変異を特定しました。さらに、核RNA輸出因子5およびヒストン脱アセチラーゼ6のミスセンスおよびサイレントバリアントは、タンパク質を部分的に破壊することが示されました。GABA作動性経路の遺伝子は以前にASDの病態生理に関与していると考えられてきましたが、これはGABA受容体遺伝子の変異を切り捨てるASD患者の最初の報告です。

A large-scale sequencing screen of X-linked synaptic genes in individuals with autism spectrum disorder (ASD) or schizophrenia (SCZ), two common neurodevelopmental disorders, identified many variants most of which have no easily predictable effect on gene function. In this report, we evaluated the impact of these rare missense and silent variants on gene splicing. For this purpose, we used complementary in silico analyses, in vitro minigene-based assays and RNA prepared from lymphoblastoid cells derived from patients with these mutations. Our goal was to identify the variants which might either create or disrupt an acceptor splice site, a donor splice site or an exonic splicing enhancer, thus leading to aberrant splicing that could be involved in the pathogenesis of ASD or SCZ. We identified truncating mutations in distinct X-linked gamma-aminobutyric acid A (GABAA) receptor subunit-encoding genes, GABRQ and GABRA3, in two different families. Furthermore, missense and silent variants in nuclear RNA export factor 5 and histone deacetylase 6 were shown to partially disrupt the protein. While genes from the GABAergic pathway have previously been thought to be involved in the pathophysiology of ASD, this is the first report of ASD patients with truncating mutations in GABA receptors genes.