エジプトからのESBL生産大腸菌臨床分離株におけるプラスミド媒介キノロン耐性決定因子QNR、AAC（6 '） - IB-CR、およびQEP

目的：拡張スペクトルβ-ラクタマーゼ（ESBL）生産性の大腸菌におけるプラスミド媒介キノロン抵抗性決定因子QNR、AAC（6 '）-IB-CRおよびQEPの有病率を特徴付けること、およびこれらの決定要因のCTX-MグループとのCTX-Mグループの関連を決定する。 材料と方法：CLSIに従って寒天希釈技術を使用して、70の大腸菌臨床分離株に対する15の抗菌剤のMICが決定されました。QNRA、QNRB、QNRS、AAC（6 '）-IB、QEP、およびCTX-M遺伝子のスクリーニングは、PCR増幅とDNAシーケンスによって実行されました。硬化を使用して、QNR、AAC（6 '）-IB、QEP、またはESBLエンコード遺伝子がプラスミド上にあるかどうかを確認しました。 結果：70の大腸菌臨床分離株のうち、61は少なくとも1つの抗生物質に耐性があり、16（22.8％）が多剤耐性、30（42％）がESBL生産者でした。30のESBL生産者のうち、大腸菌分離株のうち、8人（26.6％）がQNR遺伝子に対して陽性であり、QNRA1-、QNRB1およびQNRS1タイプの遺伝子は、それぞれ5（16.6％）、7（23.3％）および5（16.6％）分離株で単独または組み合わせて検出されました。7つの（23.3％）分離株はAAC（6 '）-IB-CRで陽性であり、QEPA4に対して陽性である2つ（6.6％）の分離株のみが陽性でした。硬化時のすべてのプラスミドの喪失は、QNR、AAC（6 '）-IB-CR、QEP A4、およびESBLエンコード遺伝子が常にプラスミド媒介であることを示唆しました。8 QNR陽性分離株のうち5はCTX-M-1とCTX-M-9の両方に関連していたが、6 AAC（6 '）-IB-CR陽性分離株から2がCTX-M-1とCTX-M-9の両方に関連していた。 結論：この研究は、エジプトからのCTX-M陽性大腸菌分離株に関連するキノロン耐性決定因子QNR、AAC（6 '）-IB-CR、QEP A4の有病率を強調しています。これは、エジプトのプラスミド媒介フルオロキノロン排出ポンプのQEP Aの最初の報告です。

PURPOSE: To characterize the prevalence of plasmid-mediated quinolone resistance determinants qnr, aac(6')-Ib-cr and qep in extended-spectrum β-lactamase (ESBL) -producing E. coli and to determine the association of these determinants with CTX-M group in Cairo, Egypt. MATERIALS AND METHODS: MICs of 15 antimicrobial agents against 70 E. coli clinical isolates were determined using agar dilution technique according to CLSI. Screening for the qnrA, qnrB, qnrS, aac(6')-Ib, qep and CTX-M genes was carried out by PCR amplification and DNA sequencing. Curing was used to confirm whether qnr, aac(6')-Ib, qep or ESBL-encoding genes were located on plasmids. RESULTS: Out of 70 E. coli clinical isolates, 61 were resistant to at least one antibiotic, 16 (22.8%) were multidrug resistant and 30 (42%) were ESBL producers. Out of 30 ESBL producers E. coli isolates, 8 (26.6%) were positive for qnr genes, and the qnrA1-, qnrB1-and qnrS1-type genes were detected alone or in combination in 5 (16.6%), 7 (23.3%) and 5 (16.6%) isolates, respectively. Seven (23.3%) isolates were positive for aac(6')-Ib-cr and only two (6.6%) isolates were positive for qepA4. Loss of all plasmids upon curing suggested that qnr, aac(6')-Ib-cr , qep A4 and ESBL-encoding genes were always plasmid mediated. Out of 8 Qnr positive isolates 5 were associated with both CTX-M-1 and CTX-M-9 while 2 from 6 aac(6')-Ib-cr positive isolates were associated with both CTX-M-1 and CTX-M-9. CONCLUSIONS: This study highlights the prevalence of quinolone resistance determinants qnr, aac(6')-Ib-cr , qep A4 associated with CTX-M positive E. coli isolates from Egypt. This is the first report of the plasmid mediated fluoroquinolone efflux pump, Qep A from Egypt.