単一クロマチン線形化のためのエラストマーナノチャネルでのナノスケール絞り

このホワイトペーパーでは、バイオポリマーの溶液で満たされたエラストマーナノチャネルを急速に狭く縮めることにより、非溶解したDNAとクロマチンが線形化される新しいナノ流体現象について説明します。このナノスケールの絞り手順は、流体力学的流れを生成しながら、バイオポリマーを小さくて少量に限定します。この技術のユニークな特徴により、完全な線形化がDNAなどのバイオポリマーのトラップが可能になります。この方法の汎用性は、クロマチンの伸縮性の分析と、単一鎖のクロマチンを使用したヒストン状態のマッピングによっても実証されています。

This paper describes a novel nanofluidic phenomenon where untethered DNA and chromatin are linearized by rapidly narrowing an elastomeric nanochannel filled with solutions of the biopolymers. This nanoscale squeezing procedure generates hydrodynamic flows while also confining the biopolymers into smaller and smaller volumes. The unique features of this technique enable full linearization then trapping of biopolymers such as DNA. The versatility of the method is also demonstrated by analysis of chromatin stretchability and mapping of histone states using single strands of chromatin.