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The American journal of psychiatry2012Dec01Vol.169issue(12)

統合失調症の臨床的次元のゲノムワイド関連研究:混乱した症状に対する多遺伝子効果

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文献タイプ:
  • Journal Article
  • Research Support, N.I.H., Extramural
  • Research Support, Non-U.S. Gov't
  • Research Support, U.S. Gov't, Non-P.H.S.
概要
Abstract

目的:複数の証拠源は、遺伝的要因が統合失調症の臨床的特徴の変動に影響することを示唆しています。著者らは、統合失調症の個人の間で、次元症状スコアの最初のゲノムワイド関連研究(GWAS)を提示します。 方法:統合失調症(MGS)サンプルの分子遺伝学からのヨーロッパの祖先の2,454人の症例被験者の精神病スケール評価の生涯次元に基づく、3つの症状因子(陽性、陰性/混乱、および気分)を探索的因子分析で同定しました。確認因子分析からの各因子の定量的スコアは、線形回帰を使用した696,491の単一ヌクレオチド多型(SNP)との関連について分析され、年齢、性別、臨床部位、および祖先の補正を行いました。ポリジェニックスコア分析を実施して、16の精神医学GWASコンソーシアム(PGC)統合失調症サンプル(MGSサンプルを除く)の症例と比較被験者が、各症状因子のMGS関連テスト結果によって計算されたスコアで異なるかどうかを判断しました。 結果:SNPと因子スコアの間にゲノム全体の有意な関連性は観察されませんでした。関連性の最も強力な証拠を生成するSNPのほとんどは、メンデルCNS疾患で役割を果たしている遺伝子を含む、神経発達、神経保護、または神経伝達に関与する遺伝子内またはそれに近いものでしたが、定義された遺伝子経路で統計的に有意な効果は観察されませんでした。最後に、MGS GWAS結果に基づくポリジェニックスコアは、負/混乱した因子の結果が、PGCデータセットの症例被験者と比較被験者の間で有意に異なっていました。MGS被験者の場合、ネガティブ/組織化された因子スコアは、他のPGCサンプルからのケースコントロールGWASの結果を使用して生成された多遺伝子スコアと相関していました。 結論:統合失調症GWASデータセットのクロスサンプル分析で観察されたポリジェニックシグナルは、ネガティブおよび混乱した症状(すなわち、慢性統合失調症のコア特徴)に対する遺伝的効果に一部関連する可能性があります。

目的:複数の証拠源は、遺伝的要因が統合失調症の臨床的特徴の変動に影響することを示唆しています。著者らは、統合失調症の個人の間で、次元症状スコアの最初のゲノムワイド関連研究(GWAS)を提示します。 方法:統合失調症(MGS)サンプルの分子遺伝学からのヨーロッパの祖先の2,454人の症例被験者の精神病スケール評価の生涯次元に基づく、3つの症状因子(陽性、陰性/混乱、および気分)を探索的因子分析で同定しました。確認因子分析からの各因子の定量的スコアは、線形回帰を使用した696,491の単一ヌクレオチド多型(SNP)との関連について分析され、年齢、性別、臨床部位、および祖先の補正を行いました。ポリジェニックスコア分析を実施して、16の精神医学GWASコンソーシアム(PGC)統合失調症サンプル(MGSサンプルを除く)の症例と比較被験者が、各症状因子のMGS関連テスト結果によって計算されたスコアで異なるかどうかを判断しました。 結果:SNPと因子スコアの間にゲノム全体の有意な関連性は観察されませんでした。関連性の最も強力な証拠を生成するSNPのほとんどは、メンデルCNS疾患で役割を果たしている遺伝子を含む、神経発達、神経保護、または神経伝達に関与する遺伝子内またはそれに近いものでしたが、定義された遺伝子経路で統計的に有意な効果は観察されませんでした。最後に、MGS GWAS結果に基づくポリジェニックスコアは、負/混乱した因子の結果が、PGCデータセットの症例被験者と比較被験者の間で有意に異なっていました。MGS被験者の場合、ネガティブ/組織化された因子スコアは、他のPGCサンプルからのケースコントロールGWASの結果を使用して生成された多遺伝子スコアと相関していました。 結論:統合失調症GWASデータセットのクロスサンプル分析で観察されたポリジェニックシグナルは、ネガティブおよび混乱した症状(すなわち、慢性統合失調症のコア特徴)に対する遺伝的効果に一部関連する可能性があります。

OBJECTIVE: Multiple sources of evidence suggest that genetic factors influence variation in clinical features of schizophrenia. The authors present the first genome-wide association study (GWAS) of dimensional symptom scores among individuals with schizophrenia. METHOD: Based on the Lifetime Dimensions of Psychosis Scale ratings of 2,454 case subjects of European ancestry from the Molecular Genetics of Schizophrenia (MGS) sample, three symptom factors (positive, negative/disorganized, and mood) were identified with exploratory factor analysis. Quantitative scores for each factor from a confirmatory factor analysis were analyzed for association with 696,491 single-nucleotide polymorphisms (SNPs) using linear regression, with correction for age, sex, clinical site, and ancestry. Polygenic score analysis was carried out to determine whether case and comparison subjects in 16 Psychiatric GWAS Consortium (PGC) schizophrenia samples (excluding MGS samples) differed in scores computed by weighting their genotypes by MGS association test results for each symptom factor. RESULTS: No genome-wide significant associations were observed between SNPs and factor scores. Most of the SNPs producing the strongest evidence for association were in or near genes involved in neurodevelopment, neuroprotection, or neurotransmission, including genes playing a role in Mendelian CNS diseases, but no statistically significant effect was observed for any defined gene pathway. Finally, polygenic scores based on MGS GWAS results for the negative/disorganized factor were significantly different between case and comparison subjects in the PGC data set; for MGS subjects, negative/disorganized factor scores were correlated with polygenic scores generated using case-control GWAS results from the other PGC samples. CONCLUSIONS: The polygenic signal that has been observed in cross-sample analyses of schizophrenia GWAS data sets could be in part related to genetic effects on negative and disorganized symptoms (i.e., core features of chronic schizophrenia).

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