レトロトランスポー可能な元素間の非アラインの相同組換えは、de novoの不均衡な転座のドライバーです

バランスの取れた染色体転座ブレークポイントの大規模な分析により、非ホモロガスの結合と微小ホモロジーを介した修復が染色体間構造異常の主要なドライバーであることが示されています。de novoの不均衡な転座のブレークポイントシーケンスは、体系的にまだ調査されていません。12のde novoの不均衡な転座を分析し、9つのブレークポイントをマッピングしました。驚くべきことに、バランスの取れた転座とは対照的に、主な変異メカニズムとして、（レトロ）転位要素と特に長い散在する要素（系統）の間の非対立遺伝子の相同組換え（NAHR）を特定します。この発見は、ゲノム再編成における（レトロ）トランスポゾンのさらに別の関与を示しており、バランスのとれた染色体転座と比較して、大きく異なる変異メカニズムを暴露します。さらに、化合物母体/父親の誘導体染色体の存在を示し、ヒトの切断段階の胚形成は染色体再生のゆりかごであるという仮説を強化します。

Large-scale analysis of balanced chromosomal translocation breakpoints has shown nonhomologous end joining and microhomology-mediated repair to be the main drivers of interchromosomal structural aberrations. Breakpoint sequences of de novo unbalanced translocations have not yet been investigated systematically. We analyzed 12 de novo unbalanced translocations and mapped the breakpoints in nine. Surprisingly, in contrast to balanced translocations, we identify nonallelic homologous recombination (NAHR) between (retro)transposable elements and especially long interspersed elements (LINEs) as the main mutational mechanism. This finding shows yet another involvement of (retro)transposons in genomic rearrangements and exposes a profoundly different mutational mechanism compared with balanced chromosomal translocations. Furthermore, we show the existence of compound maternal/paternal derivative chromosomes, reinforcing the hypothesis that human cleavage stage embryogenesis is a cradle of chromosomal rearrangements.