インディアンのNAT2配列多型とアセチル化プロファイル

背景：Broadpectrumの薬物代謝遺伝子であるNat2は、薬理化の関心が高いです。NAT2遺伝子の7つの異なる変異に基づいて、個人は遅いアセチレーターまたは高速なアセチル化剤として分類できます。 材料と方法：データが不十分なインド人のアセチル化プロファイルを特徴付けるために、250人のインディアンの873 bp NAT2コーディング領域をシーケンスし、3つの部族を含むインド全体をカバーしました。 結果：全体として、2つのアセチレーター表現型を形成する35 NAT2対立遺伝子（インドでほぼ同じ割合で分布）が見つかりました。遅いアセチル化因子を決定する対立遺伝子は高度に分化していましたが、高速のアセチル化因子対立遺伝子の数は少ないが、非常に頻繁でした。 結論：興味深いことに、2つの異なるアセチル化表現型の分布は、インドの歴史的な食事パターンとよく相関していました。世界的な人間のNat2遺伝子多型に基づいた隣接する系統樹は、同様のアセチル化表現型を持つ集団間の遺伝的親和性を明らかにしました。

BACKGROUND: NAT2, a broad-spectrum drug-metabolizing gene, is of high pharmacogenetic interest. Based on seven different mutations in the NAT2 gene, an individual can either be categorized as a slow or fast acetylator. MATERIALS & METHODS: In order to characterize acetylation profiles of Indians, where data are poorly available, we sequenced the 873 bp NAT2 coding region in 250 Indians, covering the whole of India including three tribes. RESULTS: Altogether, 35 NAT2 alleles forming two acetylator phenotypes (distributed almost in equal proportion in India) were found; while the alleles determining slow acetylators were highly differentiated, the fast acetylator alleles were less in number but highly frequent. CONCLUSION: Interestingly, distribution of two different acetylation phenotypes correlated well with historical dietary pattern in India. The neighbor-joining phylogenetic tree based on NAT2 gene polymorphisms in worldwide humans revealed genetic affinities among populations with similar acetylation phenotypes, which also placed Indians and Africans together in a single cluster.