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現在、人間の健康に危険な試薬の置換に焦点を当てた新しいソリューションは、研究所と緑の化学で非常に要求されています。現在の研究では、新しい非haz的DNA染色試薬であるゲルグリーンが、LIF検出を伴うCGEによる二本鎖DNAを分析するために初めてアッセイされました。標準DNA混合物の広い濃度範囲のS/N比と移動時間に対するゲルグリーン濃度の影響を評価しました。100〜500塩基ペア（BP）からのサイズのDNAフラグメントの効率的かつ敏感な分離のふるいバッファーにおける最適なゲルグリーン濃度の下で得られました。解像度、分析時間、LOD、LOQ、再現性、サイジングパフォーマンス、および分析コストに関する比較は、DNA分析用の2つの最適化されたCGE-LIFプロトコル間で確立されました。-DNAフラグメントのlif）および新しいゲルグリーンを使用したもう1つ。YOPRO-1を使用した分析は、ゲルグリーンを使用している分析よりも速かった（100〜500 bp DNAフラグメントの分析では約31分対34分）。反対側では、ゲルグリーンを使用した感度は、YoPro-1を使用したものよりも2倍高かった。分析のコストは、YoPro-1よりもゲルグリーンを使用して大幅に安価（9倍）でした。解像度の値とサイジングパフォーマンスは、2つの染料間で有意差はありませんでした（たとえば、両方の染料により、100〜200 bpの範囲で2 bpのみで断片の分離が異なりました）。ゲルグリーンを使用した分離法の有用性は、PCRによって得られた異なるアンプリコンの特性評価によって実証されています。
現在、人間の健康に危険な試薬の置換に焦点を当てた新しいソリューションは、研究所と緑の化学で非常に要求されています。現在の研究では、新しい非haz的DNA染色試薬であるゲルグリーンが、LIF検出を伴うCGEによる二本鎖DNAを分析するために初めてアッセイされました。標準DNA混合物の広い濃度範囲のS/N比と移動時間に対するゲルグリーン濃度の影響を評価しました。100〜500塩基ペア（BP）からのサイズのDNAフラグメントの効率的かつ敏感な分離のふるいバッファーにおける最適なゲルグリーン濃度の下で得られました。解像度、分析時間、LOD、LOQ、再現性、サイジングパフォーマンス、および分析コストに関する比較は、DNA分析用の2つの最適化されたCGE-LIFプロトコル間で確立されました。-DNAフラグメントのlif）および新しいゲルグリーンを使用したもう1つ。YOPRO-1を使用した分析は、ゲルグリーンを使用している分析よりも速かった（100〜500 bp DNAフラグメントの分析では約31分対34分）。反対側では、ゲルグリーンを使用した感度は、YoPro-1を使用したものよりも2倍高かった。分析のコストは、YoPro-1よりもゲルグリーンを使用して大幅に安価（9倍）でした。解像度の値とサイジングパフォーマンスは、2つの染料間で有意差はありませんでした（たとえば、両方の染料により、100〜200 bpの範囲で2 bpのみで断片の分離が異なりました）。ゲルグリーンを使用した分離法の有用性は、PCRによって得られた異なるアンプリコンの特性評価によって実証されています。
Nowadays, new solutions focused on the replacement of reagents hazardous to human health are highly demanded in laboratories and Green Chemistry. In the present work, GelGreen, a new nonhazardous DNA staining reagent, has been assayed for the first time to analyze double-stranded DNA by CGE with LIF detection. The effect of GelGreen concentration on S/N ratio and migration time of a wide concentration range of standard DNA mixtures was evaluated. Under optimum GelGreen concentration in the sieving buffer efficient and sensitive separations of DNA fragments with sizes from 100-500 base pairs (bp) were obtained. A comparison in terms of resolution, time of analysis, LOD, LOQ, reproducibility, sizing performance, and cost of analysis was established between two optimized CGE-LIF protocols for DNA analysis, one based on the dye YOPRO-1 (typically used for CGE-LIF of DNA fragments) and another one using the new GelGreen. Analyses using YOPRO-1 were faster than those using GelGreen (ca. 31 min versus 34 min for the analysis of 100-500 bp DNA fragments). On the other side, sensitivity using GelGreen was twofold higher than that using YOPRO-1. The cost of analysis was significantly cheaper (ninefold) using GelGreen than with YOPRO-1. The resolution values and sizing performance were not significantly different between the two dyes (e.g. both dyes allowed the separation of fragments differing in only 2 bp in the 100-200 bp range). The usefulness of the separation method using GelGreen is demonstrated by the characterization of different amplicons obtained by PCR.
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