Streptococcus pseudopneumoniaeおよび触媒不可能な肺炎の疾患分離株は、スペインの非定型S肺炎として推定されていると推定されています

私たちは、スペインの侵襲的および非侵襲的感染から回復した非定型連鎖球菌肺炎として推定的に特定された分離株の収集の性質に関する洞察を得ることを目指しました。100と32の分離株は、次のことによって特徴付けられました。周囲およびCO（2）濃縮雰囲気のオプトチン感受性。胆汁溶解度;肺炎球菌遺伝子を標的とするPCRベースのアッセイLyta、Ply、PSPA、CPSA、SPN9802、Alib-like Orf2、および特定の16S RRNA領域。多焦点シーケンス分析。および抗菌薬感受性。多焦点配列分析により、61個の分離株がS. pseudopneumoniae、34人が肺炎球菌、13人がS. MITIS、24人が非肺炎球菌として分類されたままでした。S. pseudopneumoniae分離株の中で、51（83.6％）が呼吸管のサンプルから収集されました。滅菌源から8つの分離株が得られました。ペニシリン（60.7％）およびエリスロマイシン（42.6％）に対する感受性の高い頻度が見つかりました。S. pseudopneumoniae分離株の50.8％のみが、この種についても最初に記載されている典型的なオプトチン表現型を示しました。CPSA遺伝子または肺炎球菌の典型的なLYTA制限フラグメント長の多型を抱くものはありませんでした。SPN9802および特定の16S RRNA領域は、S。pseudopneumoniae分離株の大部分（それぞれn = 59およびn = 49）の中で検出されました。PLYおよびPSPA遺伝子はめったに見つかりませんでした。高い遺伝的多様性が見つかり、59のプロファイルが特定されました。S.肺炎の中で、23人がカプセル化され、11人は触媒できませんでした。国際的なカプセル化されていない系統に関連する3つの非型型分離株が、浸潤性疾患源から回収されました。結論として、非定型肺炎球菌臨床分離株の半分は、実際にはS. pseudopneumoniaeと4分の1が他の連鎖球菌でした。S. pseudopneumoniaeと触覚不可能な肺炎球菌を、浸潤性疾患を含むスペインの疾患の原因として特定しました。

We aimed to obtain insights on the nature of a collection of isolates presumptively identified as atypical Streptococcus pneumoniae recovered from invasive and non-invasive infections in Spain. One-hundred and thirty-two isolates were characterized by: optochin susceptibility in ambient and CO(2)-enriched atmosphere; bile solubility; PCR-based assays targeting pneumococcal genes lytA, ply, pspA, cpsA, Spn9802, aliB-like ORF2, and a specific 16S rRNA region; multilocus sequence analysis; and antimicrobial susceptibility. By multilocus sequence analysis, 61 isolates were S. pseudopneumoniae, 34 were pneumococci, 13 were S. mitis, and 24 remained unclassified as non-pneumococci. Among S. pseudopneumoniae isolates, 51 (83.6%) were collected from respiratory tract samples; eight isolates were obtained from sterile sources. High frequency of non-susceptibility to penicillin (60.7%) and erythromycin (42.6%) was found. Only 50.8% of the S. pseudopneumoniae isolates displayed the typical optochin phenotype originally described for this species. None harbored the cpsA gene or the pneumococcal typical lytA restriction fragment length polymorphism. The Spn9802 and the specific 16S rRNA regions were detected among the majority of the S. pseudopneumoniae isolates (n = 59 and n = 49, respectively). The ply and pspA genes were rarely found. A high genetic diversity was found and 59 profiles were identified. Among the S. pneumoniae, 23 were capsulated and 11 were non-typeable. Three non-typeable isolates, associated to international non-capsulated lineages, were recovered from invasive disease sources. In conclusion, half of the atypical pneumococcal clinical isolates were, in fact, S. pseudopneumoniae and one-fourth were other streptococci. We identified S. pseudopneumoniae and non-typeable pneumococci as cause of disease in Spain including invasive disease.