PathVisiofaCeted Search：大きな経路の多次元ナビゲーションのための探索ツール

目的：PathVisio Faceted Searchプラグインは、Ensembl BiomartなどのWebサービスからのデータとデータをPathVisioの正式な表記法を使用して描画した図にオーバーレイすることにより、ユーザーが複雑な経路を探求および理解するのに役立ちます。プラグインは、ファセット検索と呼ばれるフィルタリングメカニズムを提供し、インポートされたデータに基づいて対象の図ノード（遺伝子やタンパク質など）を見つけて強調表示します。このツールは、複雑なクエリを処理するための柔軟なスクリプトメカニズムをさらに提供します。 可用性：PathVisio Faceted Searchプラグインは、PathVisio 3.0以降と互換性があります。Pathvisioは、Windows、Mac OS X、Linuxと互換性があります。プラグイン、ドキュメント、例の図、グルーヴィーなスクリプトは、http：//pathvisio.org/wiki/pathvisiofacetedsearchhelpで入手できます。プラグインは無料でオープンソースで、Apache 2.0ライセンスによってライセンスされています。

PURPOSE: The PathVisio-Faceted Search plugin helps users explore and understand complex pathways by overlaying experimental data and data from webservices, such as Ensembl BioMart, onto diagrams drawn using formalized notations in PathVisio. The plugin then provides a filtering mechanism, known as a faceted search, to find and highlight diagram nodes (e.g. genes and proteins) of interest based on imported data. The tool additionally provides a flexible scripting mechanism to handle complex queries. AVAILABILITY: The PathVisio-Faceted Search plugin is compatible with PathVisio 3.0 and above. PathVisio is compatible with Windows, Mac OS X and Linux. The plugin, documentation, example diagrams and Groovy scripts are available at http://PathVisio.org/wiki/PathVisioFacetedSearchHelp. The plugin is free, open-source and licensed by the Apache 2.0 License.