SMIM1はVEL血液型の根底にあり、赤血球の特性に影響を与えます

血液型VELは60年前に発見されましたが、基礎となる遺伝子は不明です。VEL抗原に対して陰性の個体はまれであり、VELに対する抗体患者の安全な輸血に必要です。原因となる遺伝子を特定するために、VEL抗原に対して負の5人のエキソームを配列決定し、4人がホモ接合体であり、1人は78-アミノ酸膜タンパク質をコードする遺伝子における低周波17ヌクレオチドフレームシフトの欠失でヘテロ接合であることがわかりました。SMIM1。64人のVEL陰性の個人のうち59人が、SMIM1をトランスフェクトした細胞上のVEL抗原の同じ欠失と発現に対してホモ接合性であることを示すフォローアップ研究では、VEL血液群の根底にある遺伝子としてSMIM1を確認しています。発現定量的形質軌跡（EQTL）、一般的なSNP RS1175550はVEL抗原の可変発現に寄与し（P = 0.003）、赤血球の平均ヘモグロビン濃度（RBC; P = 8.6×10（-15））に影響します。in vivoでは、SMIM1ノックダウンを含むゼブラフィッシュはRBCの数の軽度の減少を示し、SMIM1をRBC層の新しい調節因子として特定しました。削除のホモ接合性の存在により、Vel陰性献血者の明確な識別が可能になるため、私たちの発見は即座に関連しています。

The blood group Vel was discovered 60 years ago, but the underlying gene is unknown. Individuals negative for the Vel antigen are rare and are required for the safe transfusion of patients with antibodies to Vel. To identify the responsible gene, we sequenced the exomes of five individuals negative for the Vel antigen and found that four were homozygous and one was heterozygous for a low-frequency 17-nucleotide frameshift deletion in the gene encoding the 78-amino-acid transmembrane protein SMIM1. A follow-up study showing that 59 of 64 Vel-negative individuals were homozygous for the same deletion and expression of the Vel antigen on SMIM1-transfected cells confirm SMIM1 as the gene underlying the Vel blood group. An expression quantitative trait locus (eQTL), the common SNP rs1175550 contributes to variable expression of the Vel antigen (P = 0.003) and influences the mean hemoglobin concentration of red blood cells (RBCs; P = 8.6 × 10(-15)). In vivo, zebrafish with smim1 knockdown showed a mild reduction in the number of RBCs, identifying SMIM1 as a new regulator of RBC formation. Our findings are of immediate relevance, as the homozygous presence of the deletion allows the unequivocal identification of Vel-negative blood donors.