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血漿および血清におけるタンパク質バイオマーカーの発見は、プロテオームの広大なダイナミックレンジによってひどく妨げられています。12桁にわたるタンパク質濃度では、従来の質量分析では、少数の低存在性タンパク質のみを検出できます。サンプルからの豊富なタンパク質の事前の枯渇は、分析の深さを大幅に増加させる可能性があり、広く使用されている実践になりました。血漿と血清中の最も豊富なタンパク質の14を選択的に除去する親和性枯渇法を詳細に説明します。
血漿および血清におけるタンパク質バイオマーカーの発見は、プロテオームの広大なダイナミックレンジによってひどく妨げられています。12桁にわたるタンパク質濃度では、従来の質量分析では、少数の低存在性タンパク質のみを検出できます。サンプルからの豊富なタンパク質の事前の枯渇は、分析の深さを大幅に増加させる可能性があり、広く使用されている実践になりました。血漿と血清中の最も豊富なタンパク質の14を選択的に除去する親和性枯渇法を詳細に説明します。
Protein biomarker discovery in blood plasma and serum is severely hampered by the vast dynamic range of the proteome. With protein concentrations spanning 12 orders of magnitude, conventional mass spectrometric analysis allows for detection of only a few low-abundance proteins. Prior depletion of high-abundant proteins from the sample can increase analytical depth considerably and has become a widely used practice. We describe in detail an affinity depletion method that selectively removes 14 of the most abundant proteins in plasma and serum.
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