すべての動物種のDNAベースのレジストリ：バーコードインデックス番号（BIN）システム

多くの動物種が記載されていないため、既知の種の同定はしばしば困難であるため、暫定的な分類学的命名命名法は生物多様性分析でしばしば使用されています。これらのシステムは、運用分類単位（OTU）と呼ばれる推定種に個人を割り当てることにより、生物多様性のパターン化の調査を速め、そうでなければ不可能な研究を可能にします。OTUは従来、形態学的発散によって分離されていますが、DNAベースの描写は実行可能であるだけでなく、重要な利点があります。OTUの指定は自動化され、データは容易にアーカイブでき、調査の間で結果を簡単に比較できます。この研究では、これらの属性を活用して、シトクロムCオキシダーゼI（COI）遺伝子のバーコード領域のヌクレオチド変動のパターンの分析に基づいて、動物界の種レベルの分類学的登録を開発します。これは、以前の分類学的作業を通じて種に識別された標本のグループと、1つの新しい（RESL）を使用したCOIシーケンスのバリエーションの分析から推測されるものと4つの確立された（ABGD、作物、GMYC、JMOTU、JMOTU）アルゴリズムの対応を調べることから始めます。その後、バーコードインデックス番号（BIN）システムの実装と構造属性を説明します。生物多様性評価における実用的な役割は別として、ビンは、同義語の可能なケースにフラグを立て、地理的情報、記述的メタデータ、および同じ種に属する可能性のある標本の画像を照合することにより、記述的なメタデータを照合することにより、修正分類法を支援します。現在、274,000を超えるビンWebページが利用可能になり、急速な成長のために位置する生物多様性リソースを作成します。

Because many animal species are undescribed, and because the identification of known species is often difficult, interim taxonomic nomenclature has often been used in biodiversity analysis. By assigning individuals to presumptive species, called operational taxonomic units (OTUs), these systems speed investigations into the patterning of biodiversity and enable studies that would otherwise be impossible. Although OTUs have conventionally been separated through their morphological divergence, DNA-based delineations are not only feasible, but have important advantages. OTU designation can be automated, data can be readily archived, and results can be easily compared among investigations. This study exploits these attributes to develop a persistent, species-level taxonomic registry for the animal kingdom based on the analysis of patterns of nucleotide variation in the barcode region of the cytochrome c oxidase I (COI) gene. It begins by examining the correspondence between groups of specimens identified to a species through prior taxonomic work and those inferred from the analysis of COI sequence variation using one new (RESL) and four established (ABGD, CROP, GMYC, jMOTU) algorithms. It subsequently describes the implementation, and structural attributes of the Barcode Index Number (BIN) system. Aside from a pragmatic role in biodiversity assessments, BINs will aid revisionary taxonomy by flagging possible cases of synonymy, and by collating geographical information, descriptive metadata, and images for specimens that are likely to belong to the same species, even if it is undescribed. More than 274,000 BIN web pages are now available, creating a biodiversity resource that is positioned for rapid growth.