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デンドロビウムNobile Lindlの野生遺伝子型における遺伝的変動。インド北東部のさまざまな部分から収集され、Start Codonターゲット(SCOT)マーカーシステムを使用して分析されました。既存の自然な遺伝的多様性について、6つの自然集団で構成される合計60人が調査されました。96.21%の多型を生成するスコットマーカーによって132(132)のアンプリコンが生成されました。スコットマーカーシステムのPIC値は0.78で、プライマーのRP値は4.43〜7.50の範囲でした。25%から56.82%の多型遺伝子座(PP)の割合、0.08から0.15のNeiの遺伝子多様性(H)、平均NEIの遺伝子多様性は0.28、Shannonの情報指数は0.13から0.24の範囲の値(I)値(I)値が平均で0.24の範囲です。0.43の値が記録されました。遺伝子の流れ値(0.37)と集団間の多様性(0.57)は、集団間のより高い遺伝的変異を示しました。分子分散(AMOVA)の分析では、集団内の変動の43.37%が示されましたが、集団で56.63%の変動が記録されました。クラスター分析は、遺伝子型間の高い遺伝的変異も明らかにしています。現在の調査では、Scotマーカーシステムの有効性がD. nobileの遺伝的多様性を推定し、この絶滅危ed種の蘭種の人口と進化遺伝学に関する将来の研究の予備的なポイントと見なすことができることを示唆しています。
デンドロビウムNobile Lindlの野生遺伝子型における遺伝的変動。インド北東部のさまざまな部分から収集され、Start Codonターゲット(SCOT)マーカーシステムを使用して分析されました。既存の自然な遺伝的多様性について、6つの自然集団で構成される合計60人が調査されました。96.21%の多型を生成するスコットマーカーによって132(132)のアンプリコンが生成されました。スコットマーカーシステムのPIC値は0.78で、プライマーのRP値は4.43〜7.50の範囲でした。25%から56.82%の多型遺伝子座(PP)の割合、0.08から0.15のNeiの遺伝子多様性(H)、平均NEIの遺伝子多様性は0.28、Shannonの情報指数は0.13から0.24の範囲の値(I)値(I)値が平均で0.24の範囲です。0.43の値が記録されました。遺伝子の流れ値(0.37)と集団間の多様性(0.57)は、集団間のより高い遺伝的変異を示しました。分子分散(AMOVA)の分析では、集団内の変動の43.37%が示されましたが、集団で56.63%の変動が記録されました。クラスター分析は、遺伝子型間の高い遺伝的変異も明らかにしています。現在の調査では、Scotマーカーシステムの有効性がD. nobileの遺伝的多様性を推定し、この絶滅危ed種の蘭種の人口と進化遺伝学に関する将来の研究の予備的なポイントと見なすことができることを示唆しています。
Genetic variability in the wild genotypes of Dendrobium nobile Lindl. collected from different parts of Northeast India, was analyzed using a Start Codon Targeted (SCoT) marker system. A total of sixty individuals comprising of six natural populations were investigated for the existing natural genetic diversity. One hundred and thirty two (132) amplicons were produced by SCoT marker generating 96.21% polymorphism. The PIC value of the SCoT marker system was 0.78 and the Rp values of the primers ranged between 4.43 and 7.50. The percentage of polymorphic loci (Pp) ranging from 25% to 56.82%, Nei's gene diversity (h) from 0.08 to 0.15 with mean Nei's gene diversity of 0.28, and Shannon's information index (I) values ranging from 0.13 to 0.24 with an average value of 0.43 were recorded. The gene flow value (0.37) and the diversity among populations (0.57) demonstrated higher genetic variation among the populations. Analysis of molecular variance (AMOVA) showed 43.37% of variation within the populations, whereas 56.63% variation was recorded among the populations. Cluster analysis also reveals high genetic variation among the genotypes. Present investigation suggests the effectiveness of SCoT marker system to estimate the genetic diversity of D. nobile and that it can be seen as a preliminary point for future research on the population and evolutionary genetics of this endangered orchid species of medicinal importance.
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