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米国、イタリア、カザフスタンで世界的に成功したバチルス炭thracisの副ineageの生態学的ニッチをモデル化し、炭thrの地理的分布と地域の人口と生態学の間の潜在的な関連性をよりよく理解しました。国固有の生態学的ニッチモデルが開発され、他の国に相互に移され、病原体の存在が新しい景観で正確に予測できるかどうかを判断しました。ネイティブモデルは各国内の固有の地域を正確に予測しましたが、移転モデルは、外部国で既知の発生を予測できませんでした。さまざまな選択と遺伝データの制限の効果を考慮する必要がありますが、結果は、各国内のB. anthracis集団の異なる生態学的関連性を示唆しており、サブリネージ内のニッチの専門化を反映している可能性があります。私たちの調査結果は、この病原体の正確な生態学的ニッチモデルを開発するためのガイダンスを提供します。モデルは、地域的に、ネイティブの景観上で、人口遺伝学を考慮して開発する必要があります。さらなるゲノム分析により、これらの国全体のB. anthracisの遺伝的生態学的ダイナミクスの理解が向上し、監視および積極的なワクチン接種プログラムのためのより洗練された予測モデルにつながる可能性があります。さらなる研究では、ネイティブモデルと転送されたモデルの可変選択の影響を評価する必要があります。
米国、イタリア、カザフスタンで世界的に成功したバチルス炭thracisの副ineageの生態学的ニッチをモデル化し、炭thrの地理的分布と地域の人口と生態学の間の潜在的な関連性をよりよく理解しました。国固有の生態学的ニッチモデルが開発され、他の国に相互に移され、病原体の存在が新しい景観で正確に予測できるかどうかを判断しました。ネイティブモデルは各国内の固有の地域を正確に予測しましたが、移転モデルは、外部国で既知の発生を予測できませんでした。さまざまな選択と遺伝データの制限の効果を考慮する必要がありますが、結果は、各国内のB. anthracis集団の異なる生態学的関連性を示唆しており、サブリネージ内のニッチの専門化を反映している可能性があります。私たちの調査結果は、この病原体の正確な生態学的ニッチモデルを開発するためのガイダンスを提供します。モデルは、地域的に、ネイティブの景観上で、人口遺伝学を考慮して開発する必要があります。さらなるゲノム分析により、これらの国全体のB. anthracisの遺伝的生態学的ダイナミクスの理解が向上し、監視および積極的なワクチン接種プログラムのためのより洗練された予測モデルにつながる可能性があります。さらなる研究では、ネイティブモデルと転送されたモデルの可変選択の影響を評価する必要があります。
We modeled the ecological niche of a globally successful Bacillus anthracis sublineage in the United States, Italy and Kazakhstan to better understand the geographic distribution of anthrax and potential associations between regional populations and ecology. Country-specific ecological-niche models were developed and reciprocally transferred to the other countries to determine if pathogen presence could be accurately predicted on novel landscapes. Native models accurately predicted endemic areas within each country, but transferred models failed to predict known occurrences in the outside countries. While the effects of variable selection and limitations of the genetic data should be considered, results suggest differing ecological associations for the B. anthracis populations within each country and may reflect niche specialization within the sublineage. Our findings provide guidance for developing accurate ecological niche models for this pathogen; models should be developed regionally, on the native landscape, and with consideration to population genetics. Further genomic analysis will improve our understanding of the genetic-ecological dynamics of B. anthracis across these countries and may lead to more refined predictive models for surveillance and proactive vaccination programs. Further studies should evaluate the impact of variable selection of native and transferred models.
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