私たちが思ったほどユビキタスではありません：コスモポリタン菌のテロネクトリアの分類（蜜科、偽善、アスコミコタ）の分類学的なクリプシス、隠れた多様性、不可解な種分化）

菌類を含む微生物種の分布は、長い間コスモポリタンと見なされてきました。最近、この認識は、歴史的な生物地理学、系統発生、集団遺伝学の分子研究によって挑戦されています。ここでは、この問題を使用してこの問題を調査します。これは、ほとんどすべての地理的地域で遭遇し、コスモポリタン分類群と見なされる陶器科で最も一般的な種類の菌類の1つであるThelonectria discophoraを使用しています。T. dissophoraが単一のコスモポリタン種であるか兄弟種の集合であるかどうかを判断するために、標準的な遺伝子一致、ベイジアン一致法、および広い地理的範囲から収集された分離株の合体ベースの種ツリー再構成を含むさまざまな系統解析を実施しました。。結果は、Tと呼ばれる分離株間の多様性が非常に過小評価されており、それが種複合体を表していることを示しています。この複合施設内では、16の異なる高度に支持された系統が回収され、それぞれが制限された地理的分布と生態学があります。T. dissophoraと見なされる分離株の分類学的状態は再考され、この種の想定されるコスモポリタン分布は拒否されます。地理的に広範な種についての仮定が、分類、真の多様性、生物学的多様性の保全、および生態学的機能に関してどのように影響を与えるかについて説明します。

The distribution of microbial species, including fungi, has long been considered cosmopolitan. Recently, this perception has been challenged by molecular studies in historical biogeography, phylogeny and population genetics. Here we explore this issue using the fungal morphological species Thelonectria discophora, one of the most common species of fungi in the family Nectriaceae, encountered in almost all geographic regions and considered as a cosmopolitan taxon. In order to determine if T. discophora is a single cosmopolitan species or an assemblage of sibling species, we conducted various phylogenetic analyses, including standard gene concatenation, Bayesian concordance methods, and coalescent-based species tree reconstruction on isolates collected from a wide geographic range. Results show that diversity among isolates referred as T. discophora is greatly underestimated and that it represents a species complex. Within this complex, sixteen distinct highly supported lineages were recovered, each of which has a restricted geographic distribution and ecology. The taxonomic status of isolates regarded as T. discophora is reconsidered, and the assumed cosmopolitan distribution of this species is rejected. We discuss how assumptions about geographically widespread species have implications regarding their taxonomy, true diversity, biological diversity conservation, and ecological functions.