エネルギー省のゲノムポータル共同ゲノム研究所：2014年の更新

国立ユーザー施設である米国エネルギー省（DOE）共同ゲノム研究所（JGI）は、統合されたハイスループットシーケンスと計算分析を提供して、クリーンに関連するDOEミッションをサポートするシステムベースの科学的アプローチを可能にすることにより、多様な科学コミュニティにサービスを提供しています。エネルギー生成と環境の特性評価。JGIゲノムポータル（http://genome.jgi.doe.gov）は、すべてのJGIゲノムデータベースと分析ツールへの統一アクセスを提供します。JGIは、複雑なゲノムデータを管理および解釈するための広範なデータ管理システムと特殊な分析機能を維持しています。ユーザーは、シーケンスされたゲノムのステータス、アセンブリ、注釈など、すべてのDOE JGIシーケンスプロジェクトで利用可能な複数のデータセットを検索、ダウンロード、および探索できます。ここでは、JGIに蓄積された多様なゲノムデータの急速に増加している量の効率的な取り扱いに特に重点を置いて、過去2年間のゲノムポータルの主要な更新について説明します。

The U.S. Department of Energy (DOE) Joint Genome Institute (JGI), a national user facility, serves the diverse scientific community by providing integrated high-throughput sequencing and computational analysis to enable system-based scientific approaches in support of DOE missions related to clean energy generation and environmental characterization. The JGI Genome Portal (http://genome.jgi.doe.gov) provides unified access to all JGI genomic databases and analytical tools. The JGI maintains extensive data management systems and specialized analytical capabilities to manage and interpret complex genomic data. A user can search, download and explore multiple data sets available for all DOE JGI sequencing projects including their status, assemblies and annotations of sequenced genomes. Here we describe major updates of the Genome Portal in the past 2 years with a specific emphasis on efficient handling of the rapidly growing amount of diverse genomic data accumulated in JGI.