ヒト18SリボソームRNA遺伝子：進化と安定

ヒト18S rRNA遺伝子の1,870ベースペアプライマリシーケンスを報告し、このシーケンスと一般的な哺乳類構造に基づいて二次構造を提案します。小さなサブユニットRRNAの基本的な二次構造は、二本鎖領域における代償性および中性の塩基変化によって進化を通じて保存されています。分子には、構造が異なり、432の塩基を構成する8つの領域が含まれていますが、1,438の塩基は、テストされたすべての種の中で保存された構造の領域に属します。保存された領域は、哺乳類の放射線から約8,000万年にわたってヒトとマウスの遺伝子の間で0.1％の著しく低い配列発散率を示しています。この値は、小さなサブユニットrDNAを最も高度に保存されたシーケンスに既知のシーケンスにする可能性があります。遺伝子の複数のコピーを含む高等真核生物の配列保存は、おそらく強力な選択と不均等な相同交換によるタンデム遺伝子の補正の組み合わせによって達成されます。

We report the 1,870-base-pair primary sequence of a human 18S rRNA gene and propose a secondary structure based on this sequence and the general mammalian structure. A basic secondary structure for the small subunit rRNA has been preserved throughout evolution by compensatory and neutral base changes in double-stranded regions. The molecule contains eight regions that can vary in structure and that comprise 432 bases, while 1,438 bases belong to regions of conserved structure among all species tested. The conserved regions show a remarkably low sequence divergence rate of 0.1% between the human and mouse genes over the approximately 80 million years since the mammalian radiation. This value may make the small subunit rDNA the most highly conserved sequence known. Sequence conservation in higher eukaryotes with multiple copies of the gene is probably achieved by the combination of strong selection and the correction of tandem genes by unequal homologous exchange.