CCL4誘発性肝硬変を伴うラットの腸間膜リンパ節におけるパイロシーケンシングによる微生物叢組成

背景：腸内微生物叢と恒常性を維持するために不可欠な免疫系との間のクロストークは、腸間膜リンパ節（MLN）などの腸のリンパ組織で行われます。ここでは、コントロールおよび肝硬変ラットのMLNにおける細菌DNAの存在と、炎症反応との関係を調査しました。 方法：腹水炭素（CCL4）によって誘導された腹水ラットを伴う肝硬変ラットのMLN微生物叢は、定量的リアルタイムPCRと16S RRNA遺伝子のパイロシーケンスを使用してコントロールラットのMLN微生物叢と比較しました。血液サンプル中のサイトカインはELISAによって評価されました。 結果：予想外に、シーケンス分析により、コントロールラットと肝硬変ラットの両方のMLNが最も支配的な門の1つとして高い微生物の多様性が明らかになりました。CCL4誘発性肝障害は、細菌負荷の変化とは関連していませんでしたが、MLNSの微生物群集の微生物の多様性の減少（P <0.05）と変化に関連していました。ビフィドバクテリウム動物の高い割合も、インターロイキン-10発現の上昇と正の相関がありました（p = 0.002、誤検出率= 0.03、r = 0.94）。 結論：初めて、両方のコントロールとCCL4誘発性肝硬変ラットのMLNで観察される高い微生物の多様性は、細菌の転座が単なる二分子現象以上のものであるという証拠を提供します。

BACKGROUND: The cross talk between the gut microbiota and the immune system, which is essential to maintain homeostasis, takes place at the intestinal lymphoid tissue such as the mesenteric lymph nodes (MLNs). Here, we investigated the presence of bacterial DNA in MLNs of control and cirrhotic rats and its relationship with inflammatory responses. METHODS: The MLN microbiome of cirrhotic rats with ascites, which was induced by carbon tetrachloride (CCl4), was compared to that of control rats using quantitative real-time PCR and pyrosequencing of the 16S rRNA gene. Cytokines in blood samples were assessed by ELISA. RESULTS: Unexpectedly, sequence analysis revealed a high microbial diversity in the MLNs of both control and cirrhotic rats with Proteobacteria as one of the most dominant phylum. CCl4-induced liver injury was not associated with a change in bacterial load, but it was linked to a decrease in microbial diversity (p < 0.05) and alterations in the microbial community in MLNs. A high proportion of Bifidobacterium animalis was also positively correlated with elevated interleukin-10 expression (p = 0.002, false discovery rate = 0.03, r = 0.94). CONCLUSIONS: For the first time, the high microbial diversity observed in MLNs of both controls and CCl4-induced cirrhotic rats provides evidence that bacterial translocation is more than a mere dichotomic phenomenon.