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Nucleic acids research2014Feb01Vol.42issue(4)

U1 snRNAの切り捨てられた形態の同定は、SNRNP生合成中の新規RNA分解経路を明らかにしています

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文献タイプ:
  • Journal Article
  • Research Support, Non-U.S. Gov't
概要
Abstract

U1小さな核リボ核タンパク質(SNRNP)は、mRNA前のスプライシングとmRNAの長さとアイソフォームの発現の調節に極めて重要な役割を果たします。ただし、U1 SnRNA品質制御のメカニズムは未定のままです。ここでは、U1 SNRNP生成のための新しい監視経路について説明します。質量分析ベースのRNA分析により、SMN複合体の少数集団には、SM結合部位とSTEMループ4を欠くU1 SnRNA(U1-TFS)の切り捨てられた型が含まれていますが、7モノマチルグアノシン5 'CAPとメチル化された最初のアデノシン塩基を含むことが示されました。。U1-TFSはユニークなSMN複合体を形成し、処理体に避けられ、成熟U1 SnRNAの回転率よりも速い売上高があります。U1-TFは、U1遺伝子の転写産物から部分的に形成され、部分的には3 'ボックス要素がない、または欠陥のあるSL4コーディング領域を持つものから形成されます。U1 SNRNP生合成は厳密な品質制御下にあることを提案します。U1転写産物は3'末端領域で調査され、U1-TFは正常なU1 SNRNP生合成経路から迂回されます。

U1小さな核リボ核タンパク質(SNRNP)は、mRNA前のスプライシングとmRNAの長さとアイソフォームの発現の調節に極めて重要な役割を果たします。ただし、U1 SnRNA品質制御のメカニズムは未定のままです。ここでは、U1 SNRNP生成のための新しい監視経路について説明します。質量分析ベースのRNA分析により、SMN複合体の少数集団には、SM結合部位とSTEMループ4を欠くU1 SnRNA(U1-TFS)の切り捨てられた型が含まれていますが、7モノマチルグアノシン5 'CAPとメチル化された最初のアデノシン塩基を含むことが示されました。。U1-TFSはユニークなSMN複合体を形成し、処理体に避けられ、成熟U1 SnRNAの回転率よりも速い売上高があります。U1-TFは、U1遺伝子の転写産物から部分的に形成され、部分的には3 'ボックス要素がない、または欠陥のあるSL4コーディング領域を持つものから形成されます。U1 SNRNP生合成は厳密な品質制御下にあることを提案します。U1転写産物は3'末端領域で調査され、U1-TFは正常なU1 SNRNP生合成経路から迂回されます。

The U1 small nuclear ribonucleoprotein (snRNP) plays pivotal roles in pre-mRNA splicing and in regulating mRNA length and isoform expression; however, the mechanism of U1 snRNA quality control remains undetermined. Here, we describe a novel surveillance pathway for U1 snRNP biogenesis. Mass spectrometry-based RNA analysis showed that a small population of SMN complexes contains truncated forms of U1 snRNA (U1-tfs) lacking the Sm-binding site and stem loop 4 but containing a 7-monomethylguanosine 5' cap and a methylated first adenosine base. U1-tfs form a unique SMN complex, are shunted to processing bodies and have a turnover rate faster than that of mature U1 snRNA. U1-tfs are formed partly from the transcripts of U1 genes and partly from those lacking the 3' box elements or having defective SL4 coding regions. We propose that U1 snRNP biogenesis is under strict quality control: U1 transcripts are surveyed at the 3'-terminal region and U1-tfs are diverted from the normal U1 snRNP biogenesis pathway.

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