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活性標準的なWntシグナル伝達は、TCF/LEFファミリーメンバーによるβ-カテニンのDNAへの動員をもたらし、TCF標的遺伝子の転写活性化につながります。ただし、β-カテニンを補充してDNAにつなぐために、追加の転写因子が提案されています。ここでは、マウス腸上皮、Wnt応答性結腸直腸癌(CRC)細胞およびHEK293胚腎細胞におけるβ-カテニンDNA結合のゲノムワイドパターンについて説明します。β-カテニン結合部位の2つのクラスを特定します。最初のクラスは、DNAに結合したβ-カテニンの大部分を表し、これらの細胞の顕著なTCF/LEFファミリーメンバーであるTCF4と共局在します。2番目のクラスは、最小限のTCF4と共局在するβ-カテニン結合部位で構成されています。後者は、より低い親和性β-カテニン結合イベントで構成され、転写を駆動せず、多くの場合、コンセンサスTCF結合モチーフを含めません。驚くべきことに、TCF4の支配的なネガティブな形態は、両方のクラスの結合部位のβ-カテニン/DNA相互作用を廃止し、2番目のクラスが低親和性TCF-DNA複合体で構成されていることを意味します。我々の結果は、β-カテニンがこれら3つのシステムのTCF/LEF転写因子を介して圧倒的にクロマチンにつながっていることを示しています。
活性標準的なWntシグナル伝達は、TCF/LEFファミリーメンバーによるβ-カテニンのDNAへの動員をもたらし、TCF標的遺伝子の転写活性化につながります。ただし、β-カテニンを補充してDNAにつなぐために、追加の転写因子が提案されています。ここでは、マウス腸上皮、Wnt応答性結腸直腸癌(CRC)細胞およびHEK293胚腎細胞におけるβ-カテニンDNA結合のゲノムワイドパターンについて説明します。β-カテニン結合部位の2つのクラスを特定します。最初のクラスは、DNAに結合したβ-カテニンの大部分を表し、これらの細胞の顕著なTCF/LEFファミリーメンバーであるTCF4と共局在します。2番目のクラスは、最小限のTCF4と共局在するβ-カテニン結合部位で構成されています。後者は、より低い親和性β-カテニン結合イベントで構成され、転写を駆動せず、多くの場合、コンセンサスTCF結合モチーフを含めません。驚くべきことに、TCF4の支配的なネガティブな形態は、両方のクラスの結合部位のβ-カテニン/DNA相互作用を廃止し、2番目のクラスが低親和性TCF-DNA複合体で構成されていることを意味します。我々の結果は、β-カテニンがこれら3つのシステムのTCF/LEF転写因子を介して圧倒的にクロマチンにつながっていることを示しています。
Active canonical Wnt signaling results in recruitment of β-catenin to DNA by TCF/LEF family members, leading to transcriptional activation of TCF target genes. However, additional transcription factors have been suggested to recruit β-catenin and tether it to DNA. Here, we describe the genome-wide pattern of β-catenin DNA binding in murine intestinal epithelium, Wnt-responsive colorectal cancer (CRC) cells and HEK293 embryonic kidney cells. We identify two classes of β-catenin binding sites. The first class represents the majority of the DNA-bound β-catenin and co-localizes with TCF4, the prominent TCF/LEF family member in these cells. The second class consists of β-catenin binding sites that co-localize with a minimal amount of TCF4. The latter consists of lower affinity β-catenin binding events, does not drive transcription and often does not contain a consensus TCF binding motif. Surprisingly, a dominant-negative form of TCF4 abrogates the β-catenin/DNA interaction of both classes of binding sites, implying that the second class comprises low affinity TCF-DNA complexes. Our results indicate that β-catenin is tethered to chromatin overwhelmingly through the TCF/LEF transcription factors in these three systems.
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