正常結腸のDNAメチル化のパターンは、解剖学的位置、性別、および年齢によって異なります

DNAメチル化の変化が提案されており、結腸内にフィールドがん状態を作成します。そこでは、組織学的に正常な組織で細胞を形成する傾向がある分子変化が起こります。しかし、野外癌におけるDNAメチル化の役割の理解は、正常結腸のメチル化状態の不完全な特性によって制限されています。結腸の正常なメチル化状態を決定するために、直腸、S状、横方向、および上行結腸から正常な結腸生検からDNAを抽出し、候補候補地域とヒューマンメチル化450アレイと同様に、Pyrosequencequencequencequencequence 450アレイとともにDNAのメチル化状態を評価しました。反復元素Line-1とSAT-αのメチル化レベルは、他の遺伝子座とは対照的に、結腸全体で最小限のばらつきを示すことがわかりました。EVLのプロモーターメチル化は直腸で最も高く、近位セグメントで徐々に低くなりましたが、ESR1メチル化は高齢者でより高かった。正常なDNAのゲノム全体のメチル化分析により、それぞれ左結腸から右、雌、高齢者対若い人が右と区別される8388、82、および93の差次的にメチル化された遺伝子座が明らかになりました。生検と異なる結腸セグメント間のメチル化の変動性は反復元素では最小限でしたが、特定の癌関連遺伝子の分析とゲノム全体のメチル化分析により、結腸の位置、個々の年齢、性別に基づいた異なるメチル化が示されました。これらの研究は、正常結腸のDNAメチル化の変動に関する知識を促進します。これは、結腸磁場効果を示すメチル化の違いを理解することを目的とした将来の研究の前提条件です。

Alterations in DNA methylation have been proposed to create a field cancerization state in the colon, where molecular alterations that predispose cells to transformation occur in histologically normal tissue. However, our understanding of the role of DNA methylation in field cancerization is limited by an incomplete characterization of the methylation state of the normal colon. In order to determine the colon's normal methylation state, we extracted DNA from normal colon biopsies from the rectum, sigmoid, transverse, and ascending colon and assessed the methylation status of the DNA by pyrosequencing candidate loci as well as with HumanMethylation450 arrays. We found that methylation levels of repetitive elements LINE-1 and SAT-α showed minimal variability throughout the colon in contrast to other loci. Promoter methylation of EVL was highest in the rectum and progressively lower in the proximal segments, whereas ESR1 methylation was higher in older individuals. Genome-wide methylation analysis of normal DNA revealed 8388, 82, and 93 differentially methylated loci that distinguished right from left colon, males from females, and older vs. younger individuals, respectively. Although variability in methylation between biopsies and among different colon segments was minimal for repetitive elements, analyses of specific cancer-related genes as well as a genome-wide methylation analysis demonstrated differential methylation based on colon location, individual age, and gender. These studies advance our knowledge regarding the variation of DNA methylation in the normal colon, a prerequisite for future studies aimed at understanding methylation differences indicative of a colon field effect.