ジャガイモのパウダーろぼらなかさぶたの病原体スポンゴスポラ地下のミトコンドリアゲノムシーケンス

Spongospora subterraneaは、ジャガイモの粉末状のかさぶた病の原因となる土壌媒介の義務的な寄生虫です。S. subterraneaは、CercozoaとForaminiferaに関連する原生生物の分類群であるOrder Plasmodiophoridaのメンバーですが、これらの関係の微細な詳細は未解決のままです。現在、Cercozoan、Bigelowiella Natansの完全なmtDNAシーケンスは1つだけです。この作業では、S。bererraneaのミトコンドリア配列は、アンデスの多様なS. tuberosum sspに感染しています。Andigena（Diacol-Capiro）が提示されています。mtDNAは、呼吸鎖の16のタンパク質、11のリボソームタンパク質、3つのリボソームRNA、24 TRNA、RNA処理RNASEP、RNA指向ポリメラーゼ、および未知の機能の2つのタンパク質をコードします。これは、プラズモジオフォリドからのmtDNAゲノム配列の最初の報告であり、このグループの系統発生関係をスーパーグループRhizariaの他のメンバーともう一度MtDNAシーケンスをもう一度明らかにするのに役立ちます。

Spongospora subterranea is a soil-borne obligate parasite responsible for potato powdery scab disease. S. subterranea is a member of the order Plasmodiophorida, a protist taxa that is related to Cercozoa and Foraminifera but the fine details of these relationships remain unresolved. Currently there is only one available complete mtDNA sequence of a cercozoan, Bigelowiella natans. In this work, the mitochondrial sequence of a S. subterranea isolate infecting an Andean variety of S. tuberosum ssp. andigena (Diacol-Capiro) is presented. The mtDNA codes for 16 proteins of the respiratory chain, 11 ribosomal proteins, 3 ribosomal RNAs, 24 tRNAs, a RNA processing RNaseP, a RNA-directed polymerase, and two proteins of unknown function. This is the first report of a mtDNA genome sequence from a plasmodiophorid and will be useful in clarifying the phylogenetic relationship of this group to other members in the supergroup Rhizaria once more mtDNA sequences are available.