[ロシア北西部連邦地区で循環するパルボウイルスB19分離株のジェノタイピング]

目的：ロシアの北西連邦地区（NWFD）の領土で分離されたパルボウイルスB19分離株のジェノタイピングと系統解析。 材料と方法：NWFDのさまざまな領域から肥胞原発疹の患者から得られた61の血清および30頭の中咽頭洗浄液を、パルボウイルスB 19 DNAの存在について研究しました（PVB 19）。DNAの分離と増幅は、標準的な手法によって行われました。非構造遺伝子NS1および構造遺伝子VPIの領域を含む断片（NS1-VPLU、994ヌクレオチド）を含むDNAセグメントを配列決定し、この目的のためにオリゴヌクレオチドプライマーの元の配列を選択しました。系統解析は、ウェブサイトhttp://www.phylogeny.frでオンラインで実施されました。ツリー構造のデータはGenBankから取得されました。 結果：45％のサンプルで検出されたPVB 19 Dnawas。PVB19ゲノムセグメントは、8つのサンプルでシーケンスされました。すべてのPVB 19分離株は、1A遺伝子型の単一クラスターに属します。コミ共和国からの分離57.12は、イスラエルから分離されたISR-G株に似ています。 結論：系統解析により、世界で最も広範な遺伝子型のメンバーシップであるNWFDの領土を循環するPVB 19分離株の間に高度な遺伝的類似性が示されました。パルボウイルス感染（PVI）の局所および輸入症例が特定されました。著者らは、風疹と麻疹の制御のシステムにPVIを含める必要性について結論を出します。

AIM: Genotyping and phylogenetic analysis of parvovirus B19 isolates isolated on the territories of Northwestern Federal District (NWFD) of Russia. MATERIALS AND METHODS: 61 blood sera and 30 oropharyngeal lavages obtained from patients with maculopapular rash from various territories of NWFD were studied for the presence of parvovirus B 19 DNA (PVB 19). DNA isolation and amplification was carried out by standard techniques. DNA segment including fragment of non-structural gene NS1 and region of structural gene VPI (NS1-VPlu, 994 nucleotides) was sequenced, original sequences ofoligonucleotide primers were selected for this purpose. Phylogenetic analysis was carried out online on the website http://www.phylogeny.fr. Data for tree construction was obtained from GenBank. RESULTS: PVB 19 DNAwas detected in 45% ofsamples. PVB19 genome segment was sequenced in 8 samples. All the PVB 19 isolates belong to a single cluster of 1A genotype. Isolate 57.12 from Komi Republic is similar to ISR-G strain isolated from Israel. CONCLUSION: Phylogenetic analysis showed a high degree of genetic similarity between PVB 19 isolates circulating on the territories of NWFD, their membership in the most widespread genotype in the world. Local and import cases ofparvovirus infection (PVI) were identified. The authors make a conclusion on the necessity to include PVI into the system of rubella and measles control.