[臨床サンプルから分離されたトリメトプリム - スルファメトオキサゾール耐性のステノトロフォモナスマルトフィリア株におけるインテグロン、SUL1-2およびDFR遺伝子の調査]

非発酵グラム陰性バチルスであるステノトロフォモナスマルトフィリアは、院内および日和見感染症においてますます重要性があります。アミノグリコシド、ベータラクタム、テトラサイクリンなどの多数の広範囲の抗生物質に対する耐性を示すため、経験的治療オプションをかなり制限する可能性があります。トリメトプリム - スルファメトキサゾール（SXT）は、さまざまな患者におけるその効力と有用性が高いため、S.maltophilia感染症の治療における第一選択療法として推奨されます。しかし、近年、さまざまな地理的地域の研究がSXTに対する耐性を報告し始めています。この研究では、SUL1、SUL2、DFRA9、DFRA10、DFRA20、クラスI、SXT耐性S.maltophilia株の間でSXT耐性に役割を果たすことが知られているクラスIIインテグロン遺伝子カセットを調査することを目的としました。2006年1月から2011年10月までの間に、339人の患者のさまざまな臨床サンプルから分離された合計618人のs.maltophilia株は、トルコのトラブゾン州カラデニズ工科大学医学部医学部医学部で、研究に含まれていました。分離株は、従来の方法とフェニックス自動識別システムの両方によって識別されました（米国ベクトンディキンソン）。SXT耐性は、32人の患者（32/339、9.4％）の分離株で、自動化システムと寒天希釈法29（90.6％）が入院し、3人（9.4％）がコミュニティが取得されました。SUL1、SUL2、DFR遺伝子、クラスIおよびクラスIIインテグロン遺伝子カセットを含むSXT耐性を決定する遺伝子として知られている遺伝子は、32 SXT耐性分離株のポリメラーゼ連鎖反応を伴う特定のプライマーを使用して分析しました。その後、増幅材料のヌクレオチド配列分析が行われました。このアッセイの結果として、クラスIインテグロン遺伝子カセットとSUL1遺伝子の存在が1つの分離株で検出されました。遺伝子カセットのヌクレオチド配列分析により、アミノグリコシド6'-n-アセチルトランスフェラーゼ[AAC（6 '） - IIC]であるベータラクタマーゼタイプのオキサシリナーゼ（オキサ2）タイプのベータラクタマーゼタイプが明らかになり、アミノグリコシドの耐性、および第四字アンモニウム化合物の耐性（それぞれQACF）。結論として、私たちの知る限り、OXA2、AAC（6 '）-IIC、QACF遺伝子を含むクラスIインテグロン遺伝子カセットのシーケンスがS.Maltophiliaで初めて同定されました。S.maltophiliaのクラスIインテグロン遺伝子カセットとSul1遺伝子の共存は、多剤耐性の発達につながり、耐性の普及の潜在的な源として作用する可能性があることに留意する必要があります。

Stenotrophomonas maltophilia, which is a non-fermentative gram-negative bacillus, has an increasing importance in nosocomial and opportunistic infections. Since it exhibits resistance to numerous broad-spectrum antibiotics such as aminoglycosides, beta-lactams and tetracyclines, it may considerably limit empirical treatment options. Trimethoprim-sulfamethoxazole (SXT) is recommended as the first-line therapy in the treatment of S.maltophilia infections thanks to its high potency and usefulness in a range of patients. In recent years, however, studies in different geographical regions have started to report resistance to SXT. In this study, we aimed to investigate the genes sul1, sul2, dfrA9, dfrA10, dfrA20 and class I, class II integron gene cassettes which are known to play role in SXT resistance among SXT-resistant S.maltophilia strains. A total of 618 S.maltophilia strains isolated from various clinical samples of 339 patients between January 2006 and October 2011 at the laboratory of Medical Microbiology Department, Faculty of Medicine, Karadeniz Technical University, Trabzon, Turkey, were included in the study. The isolates were identified by both conventional methods and the Phoenix automated identification system (Becton Dickinson, USA). SXT resistance was determined in the isolates of 32 patients (32/339, 9.4%) by both the automated system and agar dilution method of them 29 (90.6%) were hospital-acquired, and 3 (9.4%) were community-acquired. The genes which are known as SXT resistance determining genes including sul1, sul2, dfr genes, and class I and class II integron gene cassettes were analyzed by using specific primers with polymerase chain reaction in the 32 SXT-resistant isolates. Subsequently, nucleotide sequence analysis of the amplified materials was performed. As a result of this assay, the presence of class I integron gene cassette and sul1 gene were detected in one isolate. Nucleotide sequence analysis of the gene cassette revealed oxacilinase (oxa2) type of beta-lactamase, an aminoglycoside 6'-N-acetyltransferase [aac(6')-IIc], leading to resistance of aminoglycosides, and a quaternary ammonium compounds resistance gene (qacF), respectively. In conclusion, to best of our knowledge the sequences of class I integron gene cassette including oxa2, aac(6')-IIc, qacF genes were identified in S.maltophilia for the first time. It should be kept in mind that the co-presence of a class I integron gene cassette and the sul1 gene in S.maltophilia may lead to the development of multi-drug resistance and may act as a potential source for the dissemination of resistance.