翻訳された偽遺伝子の検出のためのプロテオミクス技術

増加する証拠は、偽遺伝子が翻訳プロセスに到達できることを示しています。翻訳された偽遺伝子製品は、実際にはさまざまな生物で発見されており、コード化の可能性がない遺伝子として偽遺伝子の元の定義を共有しています。プロテオミクスは、タンパク質の研究を可能にする主要な技術であり、ゲノミクスと統合されると、プロテオゲノミクスとして定義されます。プロテオゲノミクスでは、ペプチドゲノムアライメントは遺伝子産物の識別と注釈を促進し、その機能をよりよく理解できるようにします。この章では、偽遺伝子に適用されるプロテオミクス技術の簡単な概要を説明します。特に、ペプチドスペクトルの獲得、大量データ分析、およびゲノムデータベースのマッチングについて説明します。

Increasing evidence indicates that pseudogenes can reach the translational process. Translated pseudogene products have in fact been found in various organisms, confuting the original definition of pseudogenes as genes without any coding potential. Proteomics is the main technology allowing the study of proteins and, when integrated with genomics, is defined as proteogenomics. In proteogenomics, the peptide-genome alignment drives the identification and annotation of gene products and allows for a better understanding of their function. In this chapter, we give a brief overview of the proteomic techniques applied to pseudogenes. In particular, we discuss peptide spectrum acquisition, mass data analysis, and genome database matching.