免疫関連遺伝子座の密なジェノタイピングは、HIV疫学研究（HERS）におけるHIV陽性女性のHPVのクリアランスに関連するバリアントを識別します

持続的な高リスクのヒトパピローマウイルス（HR-HPV）は、子宮頸がんの必要かつ因果要因です。ほとんどの女性は自然にHPV感染症をクリアします。しかし、HPVの病因に関連する生物学的メカニズムは明確に解明されていません。免疫応答を特異的に調節する宿主の遺伝的要因が重要な役割を果たす可能性があります。HIV疫学研究（HERS）のHR-HPV感染と少なくとも1回のフォローアップの半年ごとの訪問のすべてのHIV陽性女性が研究に含まれました。型固有のHPVハイブリダイゼーションアッセイを使用して、頸椎洗浄サンプルをHPVについてテストしました。タイプ固有のHPVクリアランスは、陽性テストの後、2つの連続したHPV陰性テストとして定義されました。参加者からのDNAは、カスタムイムノキップマイクロアレイを使用して、186の既知の免疫関連遺伝子座内の196,524のバリアントについて遺伝子型にされました。各単一ヌクレオチド多型（SNP）がHR-HPVクリアランスを伴う影響を評価するために、CD4+カウント、低リスクHPV（LR-HPV）Co-co-を調整して、Wei-Lin-Weissfeldアプローチを備えたCox比例ハザードモデルを使用しました。感染、および関連する交絡因子。3つの分析モデルが実施されました：人種固有（アフリカ系アメリカ人（n = 258）、ヨーロッパ系アメリカ人（n = 87）、ヒスパニック（n = 55）、人種調整された組み合わせ分析、およびプールされた独立した人種固有の分析のメタ分析。HLA-Gのバリアント（RS1633038）もアフリカ系アメリカ人に関連しています。

Persistent high-risk human papillomavirus (HR-HPV) is a necessary and causal factor of cervical cancer. Most women naturally clear HPV infections; however, the biological mechanisms related to HPV pathogenesis have not been clearly elucidated. Host genetic factors that specifically regulate immune response could play an important role. All HIV-positive women in the HIV Epidemiology Research Study (HERS) with a HR-HPV infection and at least one follow-up biannual visit were included in the study. Cervicovaginal lavage samples were tested for HPV using type-specific HPV hybridization assays. Type-specific HPV clearance was defined as two consecutive HPV-negative tests after a positive test. DNA from participants was genotyped for 196,524 variants within 186 known immune related loci using the custom ImmunoChip microarray. To assess the influence of each single-nucleotide polymorphism (SNP) with HR-HPV clearance, the Cox proportional hazards model with the Wei-Lin-Weissfeld approach was used, adjusting for CD4+ count, low risk HPV (LR-HPV) co-infection, and relevant confounders. Three analytical models were performed: race-specific (African Americans (n = 258), European Americans (n = 87), Hispanics (n = 55), race-adjusted combined analysis, and meta-analysis of pooled independent race-specific analyses. Women were followed for a median time of 1,617 days. Overall, three SNPs (rs1112085, rs11102637, and rs12030900) in the MAGI-3 gene and one SNP (rs8031627) in the SMAD3 gene were associated with HR-HPV clearance (p<10(-6)). A variant (rs1633038) in HLA-G were also significantly associated in African American. Results from this study support associations of immune-related genes, having potential biological mechanism, with differential cervical HR-HPV infection outcomes.