Proteowizardを使用して、生の質量分析データを変換します

生データが生物学的LC-MS/MS実験の質量分析計によってキャプチャされた後、それらは、ほとんどのソフトウェアによる操作のために、ベンダー固有のバイナリファイルからオープンフォーマットファイルに変換する必要があります。このプロトコルは、この変換のためにProteowizardソフトウェアの使用を詳述し、形式の機能、コーディングオプション、およびベンダーの特殊性を考慮に入れています。このプロトコルは、研究者がデータベース検索エンジンやその他のバイオインフォマティクスツールによる分析のためにデータを準備するのに役立ちます。

After raw data have been captured by mass spectrometers in biological LC-MS/MS experiments, they must be converted from vendor-specific binary files to open-format files for manipulation by most software. This protocol details the use of ProteoWizard software for this conversion, taking format features, coding options, and vendor particularities into account. This protocol will aid researchers in preparing their data for analysis by database search engines and other bioinformatics tools.