ストレス耐性野生トマト種Solanum Pennelliiのゲノム

Solanum Pennelliiは、南アメリカのアンデス地域に固有の野生のトマト種であり、乾燥した生息地で繁栄するように進化しました。その極端なストレス耐性と異常な形態のため、それは栽培されたトマト・ソラナム・リコペルシコムにとって生殖質の重要なドナーです。S. lycopersicumの大規模なゲノム領域がS. pennelliiの対応するセグメントに置き換えられる、著しく優れた農業性パフォーマンスを示す可能性のある存在性のパフォーマンスを示す可能性がある。ここでは、IL集団の両親の高品質のゲノムアセンブリについて説明します。S. pennelliiゲノムを遺伝子マップに固定することにより、ストレス耐性の候補遺伝子を定義し、これらの特性の進化に転移可能な要素が役割を果たしたという証拠を提供します。私たちの仕事は、さらにトマトの改善への道を開き、S。pennelliiの生殖質で改善できる他の無数の農業特性の根底にあるメカニズムを解読するためです。

Solanum pennellii is a wild tomato species endemic to Andean regions in South America, where it has evolved to thrive in arid habitats. Because of its extreme stress tolerance and unusual morphology, it is an important donor of germplasm for the cultivated tomato Solanum lycopersicum. Introgression lines (ILs) in which large genomic regions of S. lycopersicum are replaced with the corresponding segments from S. pennellii can show remarkably superior agronomic performance. Here we describe a high-quality genome assembly of the parents of the IL population. By anchoring the S. pennellii genome to the genetic map, we define candidate genes for stress tolerance and provide evidence that transposable elements had a role in the evolution of these traits. Our work paves a path toward further tomato improvement and for deciphering the mechanisms underlying the myriad other agronomic traits that can be improved with S. pennellii germplasm.