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設計されたオクタペプチド β ヘアピン足場内の分離された芳香族相互作用は、アリール - Trp 相互作用を除いて、すべての位置順列においてほぼ普遍的な T 字型の面と端の幾何学形状を示します。Trp の不均一な非対称インドール環は、「シールド」面の形状をめぐって競合し、FtE アリール-Trp ペアの足場の安定性を低下させます。全体的な β ヘアピン構造に対するアリール対 (溶媒による相互作用がない場合) の寄与を評価すると、Trp-Trp による十分に確立された足場の安定化よりも Trp-Phe および Trp-Tyr の寄与が優れていることが明らかになります。
設計されたオクタペプチド β ヘアピン足場内の分離された芳香族相互作用は、アリール - Trp 相互作用を除いて、すべての位置順列においてほぼ普遍的な T 字型の面と端の幾何学形状を示します。Trp の不均一な非対称インドール環は、「シールド」面の形状をめぐって競合し、FtE アリール-Trp ペアの足場の安定性を低下させます。全体的な β ヘアピン構造に対するアリール対 (溶媒による相互作用がない場合) の寄与を評価すると、Trp-Trp による十分に確立された足場の安定化よりも Trp-Phe および Trp-Tyr の寄与が優れていることが明らかになります。
Isolated aromatic interactions in designed octapeptide β-hairpin scaffolds display a near-universal T-shaped face-to-edge geometry in all positional permutations, with the exception of aryl-Trp interactions. The heterogeneous asymmetric indole ring of Trp competes for a "shielding" face geometry, which lowers the scaffold stability in FtE aryl-Trp pairs. Assessment of the contributions of aryl pairs (in the absence of solvent-driven interactions) to the overall β-hairpin structure reveals the superiority of Trp-Phe and Trp-Tyr contributions over the well-established scaffold stabilization by Trp-Trp.
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